（1）数据库建设缺乏统一的规划、分工与合作。高校图书馆数据库建设是一项长期的系统工程，周期长、投入大、见效慢。长期以来，各图书馆由于体制及隶属关系的原因形成了管理体制上条块分割，在客观上使统一分工、合作建设数据库增加了难度，再加之闭门造车、急于求成的现象十分严重，形成了各馆单独建设专题数据库，并普遍存在结构单一、规模小、专业面过于狭窄、缺乏建库规范和数据的录入标准等问题，影响了数据库的使用效率，产品的市场化、商品化更是无从谈起。
（2）数据库制作的规范和标准化程度低，标引、分编、检索点选取没有严格的质量控制，数据库的建设各自为政，分别基于不同的系统，这些低水平的数据库在本馆或小范围内或许能够使用，一旦上网联机在全球范围内调用，它们的缺陷立即会显露出来，仅不同计算机系统的互联和数据的统一规范就会出现很多麻烦，甚至会严重到无法上网交换成为废库。
（3）我国建设的数据库在类型上比较单一，中文数据库居多，外文数据库、多媒体数据库偏少。单一类型的数据库只能给用户检索提供部分的帮助，不能满足读者从多渠道获取文献信息的需求，因此只有单一类型数据库的图书馆是不能令用户满意的。
（4）高校图书馆数据库的建设过程，就是利用多媒体技术、数据库技术、数字压缩技术、光盘存储技术、网络技术等技术手段，将传统图书馆收藏的大量的印刷型文献、缩微型文献、音/视频型文献等传统介质的文献，转化为数字化的过程，即馆藏文献数字化。要把数量如此庞大的印刷型文献转化为数字化，不仅任务十分艰巨，而且数字化还需要大量的技术、设备、人力、资金、文献作保证。目前，同时具备上述条件的图书馆不多，中小图书馆就更是凤毛麟角。因此，各馆还没有能力开展大规模的数字化工作，只能根据现有的条件对部分文献实现数字化，逐步推进此项工作。然而，一些部门的决策人错误地理解“发展”二字，片面追求数量，为了扩大政绩，他们不顾有无技术基础、设备条件、经营经验与经济实力，盲目建库。数量倒是增加了，但原本就相当紧张的人力、物力和资金被不断分散，不仅所建的数据库质量得不到保证，而且影响了图书馆日常工作的正常开展，真是有百害而无一利。(www.daowen.com)
（5）重复采购，保障率低。有的馆为了克服因订购书刊资金的不足，不得不采取保刊压书、保品种压册数、保中文压外文的办法，集中在核心期刊、常用书刊的订购上。这种自我满足、实用化的原则便产生了你有我有、我无你无、重复率更高、保障率更低、学科覆盖能力低、难以形成有特色的馆藏文献资源，依据这样的馆藏“文献资源”所建成的数据库，其质量就可想而知了。在网络技术如此发达的今天，是完全可以避免的。
（6）检索效果未尽如人意。一个可行的专题数据库检索系统应是外部特征检索、主题检索、分类检索、全文检索的综合应用。目前，已经建立的专题信息数据库大多只有外部特征检索和文本方式的全文检索两种检索途径。一般的用户都能快速简便地从作者、标题、日期、版次等外部特征入手查找资料，但前提是用户已事先知道要查找的资料所在的日期及其他信息，否则，用户要想扩大或缩小检索范围，查全查准资料，并非易事。数据库缺乏科学的、辅助的检索工具，影响了它的使用效果。
（7）数据加工存储的格式众多。①以文本方式存贮的全文检索，具有占用存储空间小、不需人工标引加工、便于查找文章细节、检索结果直接可靠、检索详尽彻底、使用简便易学等优点，但在不进行任何控制的情况下，文章中的每一个字、词均可成为检索点，无形中加重了检索方面的负担，使每次检索的文献量偏多，筛选量过大，用户检索所需时间长，直接影响了查准率，造成了检索噪音。再加上“假义词” “同义词”大量存在，以及大量手工输入、扫描转存（文本）等造成错字率的存在，就更容易造成漏检错检，难以保证查全率、查准率。②以图片方式存储的全文检索，必须进行耗时、费工的人工标引和技术加工，其标引难度很大，对“原文”内容又不能直接地逐字、逐词进行检索，由于“原文”采用链接方式，检索速度相对较快，但占用存储空间大，对古籍、档案、照片和含有特殊公式、符号的科技文献能进行原貌保存。因此要提高查全率、查准确率，就必须提高文献的标引深度和数据的加工质量。③以图片文字混合方式存储的检索，是在以图片方式存储的基础上，将书中具有检索意义的内容数字化，即转为电脑可识别的文字，并辅以适当的软件工具，为读者提供快捷的检索、统计、整理和编辑功能。该方式的优点是检索快捷，原貌再现，查证方便。这种类型结合了以上两种形式的优点而克服了其不足之处，是目前文献数字化建设的最理想的首选建库方式。
（8）人员素质及其知识结构影响数据库的开发。由于多种原因，高层次、高素质的人才进不来，现有的人才又留不住，即使留住了，因管理体制问题，也难以发挥他们的作用，人才资源浪费十分严重。在实际工作中往往是精通开发数据库的计算机技术人员一般都不了解数据所涵盖专业知识，因而造成对文献分类标引、主题标引的质量不高，不清楚自己制作的数据库软件是否科学、合理、易学、实用。同样，从事文献信息标引的专业人员通常都不懂得计算机程序编写及系统设计等知识，或是只懂得一些计算机的基本操作。因此，常常由于双方的沟通和知识结构差异的问题，都会不可避免地、或多或少地影响数据库的开发进程。
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