《五帝本纪》中的“五帝”分别是黄帝、颛顼、帝喾、尧、舜。他们之间具有密切的血缘联系，“黄帝”是始祖，“颛顼”是“黄帝之孙而昌意之子也”，“帝喾”是黄帝之曾孙、玄嚣之孙、蟜极之子，“尧”是帝喾之子（名放勋），“舜”是昌意的七世孙（即黄帝的八世孙）。当然，《夏本纪》记载继承“舜”大位的“禹”是昌意的三世孙（即黄帝的四世孙），其间显有错讹与矛盾，则是另一问题，也愈益突显了这个世系与谱系的重构本质。

《五帝本纪》中的“五帝”形象克服了此前“五帝”世系的纷杂与矛盾，而代之以同宗共族的特色，即均是共祖“黄帝”的嫡系后裔。虽然这个谱系还有不少历史的空白，有间隔，不连续，但所选取的主要历史人物与历史节点具有深刻的思想意涵。显而易见，《五帝本纪》中的“五帝”带有浓郁的血缘属性和人文属性，“五帝”重视德行与功业，通过个人的努力、发明和百姓的共同劳动，逐步改善生存生活的环境和境遇，促进文明的进步和发展，而不是依靠上天的恩赐或神的庇佑，这都反映了较天命思想以及图腾崇拜、上帝崇拜与祖先崇拜进步的思想意义，具有深刻的人文价值与实践功能。因此，《五帝本纪》中的“五帝”既反映了历史一脉相承的特点，又有重人文、重理性的思想文化特征。这些记载虽然与《诗经》《尚书》记载的殷商时期依然保留着厚重的图腾崇拜、上帝崇拜、祖先崇拜（《诗经·生民》《诗经·玄鸟》等）不完全一致，却深刻反映了秦汉时期历史叙述重构的思想本质。(www.daowen.com)

这种重构的影响因素大致源于三个要素，分别是：战国中晚期炎黄信仰的形成发展与黄老之学的兴起，新型国家统一趋势在思想上的诉求和反映，阴阳思想与五行思想的汇合与交融。