达尔文是一位性格平和、实事求是的博物学家，他喜欢观察，喜欢化石。他的名字前面的一长串各式各样的称号，都是后人添加的头衔。在《物种起源》中，达尔文甚至没用“进化”（evolution）一词，而是采用了“更改的后代”（descent with modification）一词，因为他认为，进化一词含有进步的含义，物种的遗传变化只是为了适应变化的环境，并没有进步或退步的含义。达尔文除了收集各个物种的标本，还收集了大量化石。但是，达尔文当时还无法分辨清楚这些化石，也没有条件进行统计学的分析。

欧仁·杜布瓦（Eugene Dubois，1858—1940）

瑞典“分类学之父”林奈，将现代人类命名为Homo sapiens，拉丁语意思是“智慧的人”（wise man）。19世纪，考古发现智人不止一种，很多类似智人的化石也出现了。

1856年，德国尼安德尔谷地（Neander Valley）发现第一批古人类遗骨，被命名为尼安德特人。1890年代，荷属东印度（现印度尼西亚）的爪哇岛发现亚洲直立人的化石。1920年代，中国发现周口店猿人（Zhoukoudian Sinanthropus）……

欧仁·杜布瓦（Eugene Dubois，1858—1940）是一个坚忍不拔的荷兰人，他在荷属东印度群岛经过二十多年的挖掘——当然不是他亲自动手，而是雇用了大批囚犯——终于在爪哇岛发现一种直立人的化石。他把这种猿人命名为Pithecanthropus（英语erect ape-man：爪哇直立猿人）。1950年代以后，人们把在爪哇和中国发现的这两种亚洲直立人分别命名为爪哇人（Java man）和北京人（Peking man）。

但是，正如达尔文的推测，世界上化石最多的地方在非洲。1920年代，非洲的猿人化石开始大量出土，远远超过欧洲和亚洲。1921年，赞比亚发现第一个猿人化石。1922年，雷蒙德·达特（Raymond Dart）被任命为南非威特沃特斯兰德大学（University of the Witwatersrand）的人类学教授，开始组建一个人类学系。1924年，达特确认，在赞比亚发现的是迄今最古老的猿人化石。1959年，在距离赞比亚几千千米的肯尼亚，路易斯·李基（Louis Leakey）发现了一个175万年前的南方古猿（Australopithecus）。这一考古发现，将非洲地区的远古类人猿的生存年代延长了大约一倍。此后的考古发现，非洲人科生物的化石年代越来越久远，分布越来越广泛。

此后的几十年里，越来越多的非洲南方古猿（Southern Ape Man）的化石大量出土，其数量之大，超出世界上其他所有地方的总和。人类起源于非洲的理论，在事实面前逐渐被世界接受。

非洲南方古猿（Southern Ape Man）的年代逐渐向前延伸：300万年，400万年……最新发现的类似黑猩猩的猿人Ardipitbecus（地猿）进一步把非洲猿人的年代延伸到560万年前的中新世（Miocene）。但是，伯克利大学计算出来的“线粒体夏娃”这个现代智人的诞生时间，仅仅不到20万年，这到底是怎么一回事？

雷蒙德·达特（Raymond Dart，1893—1998），以发现多处非洲猿人而著名

1974年11月，露西（Lucy）在埃塞俄比亚出土，她的年龄约20岁，生活年代约320万年前。露西属于南方古猿阿法种（Australopithecus afarensis），这种古猿与现代人的关系目前仍不清楚。露西被列为联合国世界文化遗产

化石是确凿无疑的证据，但也可能把我们引入歧途。化石给予我们认知远古历史的证据和知识，但是无法给出生物谱系（genealogy）。只有基因可以找出我们的谱系。一切都取决于这些人科生物出现的时间。

线粒体数据和模拟计算分析反复证实，现代人类从非洲进化而来，然后散布全球，取代了所有的人科生物远亲。虽然这个结论非常残酷，但是与考古学、人类学、语言学、气候学等学科的综合结论完美地吻合在一起。这一切发生在仅仅十几万年前。

更加详细的研究证明：4万年前到200万年前的尼安德特人、北京人、爪哇人、南方古猿等，现在都没有留下任何基因的痕迹，也没有分别独立进化成现代人的证据，虽然它们的形态与我们人类多多少少有些相似，虽然它们都是比现代人类更早走出非洲的类人生物，但是它们都已经彻底灭绝了。

我们的祖先几万年前走出非洲，所有的遗传数据都支持这一观点。非洲的多态性是世界上最丰富的：非洲的一个村子里的居民的高度分离的基因遗传血统，就超过世界所有其他地方的多态性数量的总和。更准确地说，在我们人类这个物种的遗传多态性（genetic polymorphisms）中的绝大部分多态性仅仅存在于非洲。欧洲—亚洲—南北美洲的多态性只占很小一部分，比不上任意一个非洲村庄。(www.daowen.com)

我们是唯一存留的人种，多起源说再次被证明是错误的。

但是，人类考古史上，学者们曾经并不这样认为。每一块出土的人类化石都曾引发出一场争论。在欧洲、亚洲和非洲，许多年代久远的古代遗址出土了毫无疑问的人类活动遗迹。其中出土最多的遗物是石器，因为石器容易保存下来，真正的人类骨骼却极其罕见。围绕这些化石，古人类学家研究和争论了很多年：

图尔卡纳男孩（TurkanaBoy），1984年在肯尼亚图尔卡纳湖（Lake Turkana）出土，是世界上最完整的一具骨骼。男孩年龄11—12岁，年代150万—160万年

铁器时代的颅骨穿孔术（A skull showing evidence of trepanning）

能人，Homo habilis

直立人，Homo erectus

海德堡人，Homo heidelbergensis

尼安德特人，Homo neanderthalensis

……

命名虽然五花八门，但是所有这些分类的定义都是根据骨骼的解剖形态，而不是以生物学意义上“彼此是否可以杂交产生健康后代，并且后代是否也能继续传承”为依据。考古学的这些分类只是为了便于研究，骨骼形态根本无法查明不同地区的人类能否成功杂交。如果能够杂交，就能进行基因交流，因为同一物种处于同一个基因库里。如果不能杂交，不同物种之间就不会交流基因，位于互相隔离的基因库中的不同的物种之间进化的道路无可挽回地分道扬镳了。

化石记录只能告诉我们早期的各种人科生物，在离开家乡之前在非洲度过了几百万年。中国和爪哇的化石，与古老的非洲直立人相似，不仅表现在体质形态上，还表现在遗址中的石器类型上。但是，毫无疑问，它们都已经灭绝了。所有的其他人科生物都进入了进化的死胡同，在最后一个尼安德特人死亡之后，它们永远消失了……

美国克里夫兰博物馆展出的三角龙属（Triceratops）