1991年7月，俄国地质学家亚历山大·亚夫多宁（Aleksander Avdonin）在俄国乌拉尔地区叶卡特琳堡（Ekaterinburg）郊外的白桦林中一个浅浅的墓穴里，挖出了九具遗骸。这是他多年坚持不懈研究的结果，他认为这里是沙俄皇室的最后一代罗曼诺夫家族（Romanovs）的埋葬地。

1918年7月16日的晚上，为了防止正在攻城的白俄军队救走囚禁在叶卡特琳堡的皇室一家，莫斯科下达了处决他们的命令。除了末代沙皇尼古拉斯二世（Nicholas II），还有他的妻子亚历山大皇后（Alexandra）、他们的五个孩子、他们的医生和三个仆人。批准执行死刑的批复，凌晨1:00才从莫斯科传达下来。夜里1:30，卡车开到房前准备带走“尸体”时，沙皇全家人才被叫醒并被告知，由于城里战乱，他们后半夜必须待在地下室才安全。

沙皇尼古拉斯二世

过去的两个星期里，罗曼诺夫一家每天晚上都会听到远远的炮声，所以没有意识到这个要求有什么特别的企图。他们安安静静地下了楼，走到地下室。士兵让他们排成队列时，他们也没有丝毫的怀疑。然后，行刑队长向沙皇走过来，一只手从口袋里拿出一张纸，另一只手握着夹克衫里的左轮手枪，匆匆读了一遍宣判死刑的通知。沙皇困惑地看了看他的全家，又看了看士兵。士兵举起了武器，女孩子们尖叫起来。枪开火了，首先击中的是沙皇，他倒在地上。受害者的尖叫声、枪声和子弹在房间里弹跳的声音交织成一片，地下室里一片混乱，士兵们更难瞄准慌乱躲避的目标。长官下令停止射击，其余的人用刺刀和枪托解决。不到三分钟，统治俄罗斯300年的罗曼诺夫王朝结束了。

这栋房子现在已不复存在，沙皇罗曼诺夫全家人的下落长期保持神秘。苏联宣传部门声称罗曼诺夫全家被带到安全的地方保护了起来。死刑说法的证明，完全取决于确认墓葬坑中取出的遗体究竟是不是罗曼诺夫一家。至少埋藏尸体的地点同现有的记录是相符的——尸体被装上一辆卡车，运到郊外的树林里。根据某些说法，当时卡车陷入泥浆，尸体被扔进了一个草草挖出来的坑里。运送者在尸体上浇硫酸，试图消灭一切可供辨认的特征。

这些挖掘出来的骨头被装配起来之后，清楚地显示出只有九具。如果集体屠杀的受害者都埋在同一个坟墓里，就缺少两具尸体。整修800多块骨头和被行刑队枪托砸烂的头骨碎片是一项耗费时间的艰巨工作。由骨架得出的九具尸体分别是：沙皇；皇后；五个孩子中的三个：玛丽亚（Maria）、塔蒂阿娜（Tatiana）、奥尔加（Olga）；沙皇的医生尤加尼·波特金（Eugeny Botkin）；以及三个仆人：贴身男仆阿莱克谢·特拉普（Alexei Trupp）、厨师伊凡·卡利多诺夫（Ivan Kharitonov）、皇后的女仆安娜·德米多娃（Anna Demidova）。没有找到沙皇最年轻的女儿阿纳斯塔西娅（Anastasia）和皇太子阿莱克谢（Alexei）的尸体。

尼古拉斯二世全家照

苏联解体后，俄国政府在沙皇全家遇害地修建的纪念教堂

除了拼接骨架以外，还有什么更好的办法，可以确认这些遗骸的身份呢？

赛克斯被邀请从叶卡特琳堡的遗骸中提取DNA，以证明他们是否是罗曼诺夫一家。这项工作由俄罗斯科学院和英国法医科学服务处负责。首先，研究人员用常规的法医遗传指纹识别骨架的性别，确定他们的确是父母双方和三个孩子组成的家庭。然后，从推测是波特金医生和仆人们的遗骨中提取的DNA显示，他们与这个家庭没有关系，他们彼此之间也没有关系。至此，所有情况与骨骼专家的结论全都吻合。

赛克斯成功地从骨骼中找到了线粒体DNA，在家庭组中发现了两组不同的序列。被推测为沙皇皇后的女性成人，与三个孩子有着完全相同的线粒体。家庭组中被推测为沙皇的男性成人，有不同的线粒体序列——这与预期的家庭结构相符。三个孩子从他们的母亲那里遗传了线粒体DNA序列，他们的父亲从他自己的母亲那里遗传了线粒体DNA序列，没有传给他的孩子们。

但是，提取线粒体DNA和测定DNA序列本身，并不能确认这个家庭就是罗曼诺夫一家，任何家庭都会显示孩子和母亲完全一样，而与父亲不同。证明究竟是哪个家庭的唯一办法是找到沙皇和皇后的母系亲戚。他们不必是近亲，线粒体DNA的真正威力在于不会因距离而被冲淡。只要亲戚之间的关系是母系，线粒体DNA就是一样的。(www.daowen.com)

沙皇和皇后健在的直接母系亲戚都能找到。欧洲皇室之间婚姻关系很密切，在遗传学上，他们几乎就像是同一个村子的邻居。这是曾经以联姻控制几乎整个欧洲几百年的哈布斯堡王朝以来的传统。沙皇未中断的母系亲戚是皇室：沙皇的外祖母是丹麦皇后露易丝·赫西·卡斯尔（Louise Hesse Cassel），她的一个后代是尼古莱·特鲁贝特斯戈伊伯爵（Nicolai Trubetskoy），这位伯爵是银行家，现在70岁，退休后住在哥特达祖尔（Cote d'Azur）。皇后的未中断的母系亲戚也是皇室：直接母系亲戚爱丁堡公爵，即英国女王伊丽莎白二世的丈夫菲利浦亲王（Philip）。这两个人都同意提供样本，提取他们的DNA。

被推测为皇后和三个孩子的序列类型出来了：他们都有完全相同的序列“111，357”，他们都与爱丁堡公爵完全相符。但是，用同样的方法，被推测为沙皇的成年男子却不吻合。他的DNA序列与退休银行家特鲁贝特斯戈伊伯爵的不完全相同。特鲁贝特斯戈伊的序列是“126，169，294，296”，但被推测为沙皇的DNA只有126，294和296，非常相似，但不一样。

这是一个挫折。已有许多的旁证把尸体与罗曼诺夫一家联系在一起，女性DNA也与爱丁堡公爵完全吻合。男性基本吻合，但不是完全吻合。如果这具尸体与特鲁贝特斯戈伊伯爵跨越六代的母系关系没有被打断，两者的线粒体DNA序列应该完全吻合才能得出结论。会不会家谱记载特鲁贝特斯戈伊伯爵是沙皇的亲戚，实际上伯爵却不是？如果这样的话，其间必然有什么地方中断了，这条血统线索上某个人有一个与家谱记载不同的母亲。这有一定可能性，比如收养关系或生产时弄错了，但可能性非常小。

也许，这具尸体不是沙皇？既然常规遗传指纹已经鉴定出他是墓中三个孩子的父亲，那么结论只能是“这里并非罗曼诺夫一家的墓地”。

必须继续研究分析。只有一个办法可以解决这个问题：把DNA克隆出来。

克隆是把混合在一起的DNA分子分开的唯一方法。简单地说，就是诱导细菌接受一个DNA分子，然后把它当自己的DNA来复制。实验终于成功获得了“沙皇”线粒体DNA的28个克隆，然后一一分别测序：其中21个包含了“126，294，296”，没有169突变；还有7个克隆的DNA额外包含169突变，与特鲁贝特斯戈伊伯爵的DNA完全一致。

这次研究，非常巧合地遇到一次罕见的正在出现的新突变（169的位置），这种情况人们以前了解很少，1994年发表关于罗曼诺夫家族遗体的论文时，这还是一件新鲜事。这一结果正是研究人员寻找的证据，证明叶卡特琳堡的“沙皇”骨骼和沙皇尼古拉斯二世仍然健在的亲戚之间明确的连续性母系联系，他们确实是沙皇一家。但是还有一个谜团尚未解开。人们只发现了罗曼诺夫家族的五具尸体——两个成人和三个女孩，沙皇最小的女儿阿纳斯塔西娅（Anastasia）和皇太子阿莱克谢（Alexei）的遗骸，至今下落不明。

皇太子阿莱克谢（Alexei）

沙皇尼古拉斯二世（Nicholas II）与亚历山大皇后（Alexandra）

于是，这场调查闹剧，长期成为媒体的热门娱乐内容。 但是，整个沙皇家庭都被杀害是基本确定的事实。根据一些书面记载，那些负责处理尸体的人，本来打算在发现遗骸的墓穴附近的树林里烧掉尸体。他们堆起了一个火葬柴堆，先把最小的阿莱克谢的尸体放上去，然后是一个沙俄公主，再在他们身上泼洒汽油并点火。火焰没有把尸体烧光，牙齿和碎骨散落四周。于是计划改动了，剩下的尸体被扔进了浅浅的墓穴。如果这份事件过程的记录是真实的，那么，阿莱克谢和阿纳斯塔西娅最后的遗骸就不在墓穴里，而在乌拉尔山的森林里。

经过越来越多的DNA研究和知识普及，人们才惊讶地发现所有欧洲人的DNA其实都差不多，超过99.99%都是一样的。遗憾的是，这种亲属关系，还不至于近到可以申请认领罗曼诺夫家族的巨额海外遗产。