地球上所有的人类都是一个物种、一个起源，都源于非洲，如果真的如此，为何我们的相貌和体形会有这么多差异？尤其是皮肤的颜色？所以，在继续我们的故事之前，首先回答这个困惑人类很多年的问题。

非洲人有一个共同点，皮肤比较黑。事实上，热带地区的印度南部的人类和新几内亚的人类的皮肤也比较黑，也属于黑人。人类是没有皮毛保护的生物，所以，沉积在皮肤下的黑色素（Melanin）成为人类的一个保护层——防止非洲炙热的阳光晒伤皮肤，因为黑色素能挡住紫外线。那么，在皮下沉积多少黑色素才合适呢？涉及肤色的遗传基因很多，其中发挥主要作用的是一个叫MC1R （melanocortin 1 receptor，黑皮质素1号受体），或称MSHR（melanocyte-stimulating hormone receptor，黑素细胞刺激荷尔蒙受体）。黑色皮肤的形成来自自然选择的压力：因为人类需要更多的黑色素保护皮肤。所以，热带地区的人们的皮肤下沉积了大量的黑色素。

6万年前，人类走出非洲，进入紫外线少得多的地区，自然选择的压力颠倒过来，人类需要更多的紫外线——这时，MC1R基因发生突变：人类必须吸收更多的紫外线才能合成维生素D，皮肤太黑的孩子会缺乏维生素D，无法生成健康的骨骼，淡色皮肤的孩子们才能吸收更多的紫外线而健康成长——于是，人类的皮肤颜色变浅（尤其是欧洲和东亚地区的人类）。最后，世界各地的人类，形成了各式各样的肤色。

来自非洲西部的尼日尔-刚果语系的群体，在2 000—3 000年前扩张到非洲撒哈拉以南大部分地区，目前人口已达3亿多。班图语族的群体皮肤特别黑，他们的形象误导了我们对非洲人的肤色的认识。在现代人类的起源地东非大裂谷—苏丹—埃塞俄比亚—肯尼亚—坦桑尼亚一带生活的非洲群体的皮肤，直到现在仍然并不很黑。(www.daowen.com)

全世界70亿人中，每一个男人和女人的线粒体DNA都源自非洲，每一个男性（占70亿人中一半）的Y染色体也都源自非洲。除了黑色的皮肤，非洲人和其他各大洲的人类没有区别。例如，几万年前来到欧洲的人类与当时非洲的先祖的样子应该差不多，虽然我们并不知道当时的先祖的真实模样，因为变化是后来发生的。

上图是瓶颈效应时的遗传漂变示意图。发生巨变或灾难导致人口急剧减少时出现瓶颈效应，本来数量相似的球体随机出现蓝球比黄球多的概率，下一代的蓝球就比黄球多。这也是两种DNA后裔不平衡的原因之一。
在人类六万年的迁移中，多次发生巨变和灾难。几个氏族的合并点（coalescence point）是远古群体的分离点。人类的群体越小，越容易发生漂变，导致这一代与下一代差异显著