各种强极性的有机酸、有机碱的分离分析是液相色谱法中的重要课题。利用吸附或分配色谱法一般需要强极性的洗脱液，并容易发生严重的拖尾现象。利用离子交换色谱法需要选择合适的pH 值条件。若利用离子对色谱法，则分离效能高、分析速度快、操作简便。因此，近年来这种方法已逐渐取代了离子交换色谱法，发展十分迅速。

离子对色谱法是将一种（多种）与溶质分子电荷相反的离子（称为对离子或反离子）加到流动相或固定相中，使其与溶质离子结合形成离子对化合物，从而控制溶质离子的保留行为的一种分离技术。在色谱分离过程中，流动相中待分离的有机离子X+（也可以是带负电荷的离子）与固定相或流动相中带相反电荷的对离子Y-结合，形成离子对化合物XY，然后在两相间进行分配。

KXY是其平衡常数，有(www.daowen.com)

根据定义，溶质的分配系数DX为

这表明，分配系数与水相中对离子Y-的浓度和KXY有关。离子对色谱法根据流动相和固定相的性质可分为正相离子对色谱法和反相离子对色谱法。在反相离子对色谱法（这是一种最为常用的离子对色谱法）中，采用非极性的疏水固定相（如十八烷基键合相），含有对离子Y-的甲醇-水（或乙腈-水）溶液作为极性流动相。试样离子X+进入柱内后，与对离子Y-生成疏水性离子对XY。后者在疏水性固定相表面分配或吸附，对离子可在较大范围内改变分离的选择性。离子对色谱法，特别是反相离子对色谱法解决了以往难分离混合物的分离问题，诸如酸、碱和离子、非离子的混合物，特别是对一些生化样品（如核酸、核苷、儿茶酚胺、生物碱以及药物等）的分离。另外，还可借助离子对的生成给样品引入紫外吸收或发荧光的基团，以提高检测的灵敏度。