1.压力的影响

提高反应的气体压力有利于提高电池的电动势。压力对电池热力学电压的影响可以用Nernst方程表示，对于PAFC，有

压力系数在190℃下为138mV，ΔV同时还是电流密度的函数。实验表明在190℃下压力从4.7atm增长到9.2atm，若电流密度为100mA/cm²，ΔV=35mV；当电流密度为400mA/cm²时，ΔV=43mV。

2.温度的影响

虽然热力学方程给出PAFC的热力学电动势随温度升高而降低，但是温度升高能减小电极的极化，提高电池性能。实验表明，在中等的电流密度250mA/cm²下，在PAFC运行的温度区间180～250℃内电池电动势随着温度升高而线性升高，测得的温度系数为1.15mV/℃。温度升高对于氢氧化反应作用甚微，然而提高温度有利于氢电极对CO的耐受性，商用化的PC25PAFC的工作温度为207℃。

3.气体利用率的影响

当反应气体供应不足时会使电极的极化作用增大，其作用对于氧电极更为明显，当以空气代替纯氧时，电流密度将下降至1/3。随着对空气中O₂利用率的升高，氧电极的极化作用明显增强，典型的商用PAFC的O₂利用率为50%，因此引起的氧电极极化为19mV。而氢的还原反应基本是可逆的，明显的极化作用仅在很高氢气利用率（＞90%）的情况下发生。由于气体分压导致的极化可由经验公式（13-7）表示：(www.daowen.com)

Δη=blg（p₂/p₁） （13-7）

式中，p₁、p₂表示气体的平均分压。

对于H₂，b=55mV，对于O₂，b=148mV（当氧气分压为0.04～0.20atm时），b=96（当氧气分压为0.20～1.00atm时）。当气体利用率低，特别是空气利用率低的时候电池性能较好，但过低的气体利用率在实用中同样会增加成本，较为合理的利用率是H₂85%，O₂50%。

PAFC的一大优势是可以用纯氢之外的燃料气体，例如重整气作为燃料，其中大多数含碳气体如CO₂和CH₄是惰性成分，然而其中的CO对于Pt催化剂具有很强的毒性，主要原因是CO能与过渡金属形成较强的p-p共轭配位键，在Pt表面CO的吸附能力远高于H₂，即使含量仅为H₂的2.5%，CO也能占据Pt表面30%的吸附位点。CO的这种失活能力随着温度的升高降低。

含硫的气体如H₂S和COS（氧硫化碳）同样会使催化剂中毒，因此在引入PAFC之前必须除去。PAFC的燃料气中含硫化合物的总含量应小于50ppm，H₂S的含量应小于20ppm，而煤重整气中H₂S的含量在100～200ppm之间。此外H₂S与CO对电极极化的影响并非是简单相加，而是有协同作用，即两者的共同的极化作用大于各组分单独极化作用之和。