KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）是一个整合了基因组、化学和系统功能信息的数据库，由日本京都大学生物信息学中心创建并维护（http://www.kegg.jp/kegg/annotation/enzyme.html）。

KEGG ENZYME数据库是KEGG下的子数据库之一。其特色在于除了酶的基本信息，还提供了关于该酶参与的反应、来源生物和蛋白质序列方面的信息，并列出关于该酶在KEGG其他子数据库和生物信息学网站的链接。

【应用实例】应用KEGG ENZYME数据库检索β-半乳糖苷酶的信息。

KEGG ENZYME数据库中酶的检索可以通过两种方式实现。首先可以在KEGG ENZYME数据库（http://www.kegg.jp/kegg/annotation/enzyme.html）中输入酶的英文名称直接进行检索，结果将只显示KEGG ENZYME数据库的检索结果。对于β-半乳糖苷酶，直接输入“β-galactosidase”即可得到如图2-7所示的检索结果。

“β-galactosidase”对应多个EC编号，KEGG ENZYME列出了所有可能的EC编号，编号后面为该编号的酶常用的名称。通常情况下，“β-galactosidase”意为“乳糖酶”（lactase），因此点击“3.2.1.23”即可查看详细信息。另外，也可以在KEGG数据库主页（http://www.genome.jp/kegg/）的检索框中输入酶的英文名称进行检索，可以得到多个KEGG子数据库的检索结果，其中包括KEGG ENZYME。除了通过酶的英文名称进行检索外，还可以输入酶的EC编号进行精确检索，这样得到的检索结果将只有该EC编号对应的链接。(www.daowen.com)

点击要查看的EC编号链接“3.2.1.23”，将得到一个以EC编号为标题的页面，详细的结果以表格形式列出（图2-7），包括的栏目有“Entry”“Name”“Class”“Sysname”“Reaction（IUBMB）”“Reaction（KEGG）”“Comment”“Hist ory”“Pathway”“Orthology”“Genes”“Reference”“Other DBs”和“LinkedDB”。

图2-7 KEGG ENZYME数据库中关于β-半乳糖苷酶EC 3.2.1.23的信息图

“Entry”为EC编号，KEGG ENZYME数据库以EC编号作为酶在数据库中的登录号。“Name”一栏列出了酶的各种名称，包括习惯名（如“β-galactosidase”“lactase”）和商品名（如“maxilact”“lactozym”），但是系统名单独在“Sysname”这一栏中显示。“Class”一栏给出了酶的类别信息，并附有简要说明。本例中检索结果显示“Hydrolases；Glycosylases”表明β-半乳糖苷酶属于水解酶大类下的糖苷水解酶。酶催化反应的信息分两栏显示：“Reaction（IUBMB）”为国际生物化学与分子生物学联合会（IUBMB）对酶的催化反应的说明；“Reaction（KEGG）”一栏为该酶参与的KEGG数据库中特定反应的链接，其中“R01100”为乳糖水解反应，点开该链接即可查看反应的详细信息。“Comment”和“History”分别为该EC编号的酶的备注、创立和修改信息。“Pathway”一栏的链接为酶在生物体内参与的代谢途径，打开可见酶参与的代谢途径图，其中所检索的酶在图中以红色字体显示，并以红色方框框出。“Orthology”一栏的编号为根据同源性对酶进行的分类，每一个编号代表一个类别，同一类别的酶具有亲缘关系，并在生物体内具有相似的功能。“Genes”一栏展示的是不同来源的酶的基因信息。对于本例，第一行为“HSA:2720（GLB1）”，其中HSA为“homo sapiens”的缩写，表明该酶来自人类，打开编号对应的链接即可查看来自人体的β-半乳糖苷酶的编码序列和氨基酸序列等相关信息。“Reference”展示了酶的研究历史中的重要文献，这些文献一般都附有在NCBI PubMed数据库中的编号（PMID），点击编号即可跳转到文献在NCBI PubMed中的页面。“Other DBs”提供该酶在其他酶数据库中的链接，可以通过它方便地在其他数据库中查看酶的信息。“LinkDB”则提供了更为丰富的酶在其他数据库中的链接，这些数据库涉及代谢途径、化学物质、化学反应、基因、蛋白质序列、DNA序列、三维结构和蛋白质结构域等方面，可以通过这些数据库的链接非常方便地获得这些方面的酶信息。

[1]原子质量和分子质量国际单位为u，在生物化学、分子生物学和蛋白组学中经常用道尔顿（Da），为与同类科技文献一致，本书中沿用单位道尔顿。