为了使酶的命名更为清晰、科学和系统化，1961年国际生物化学联合会（International Union of Biochemistry，IUB）酶学委员会（Enzyme Commission，EC）推荐了一套新的系统命名方案及分类方法，之后不断补充和完善，目前已被国际生物化学联合会和研究人员广泛接受和认可。系统命名法以酶催化的反应为基础，明确表明酶的底物及其催化反应的性质，给每个酶一个系统命名的编号。系统命名法共有4个阿拉伯数字，数字之间用“.”分隔开。这一命名法可以清晰地表明酶的反应底物、产物、性质以及其他一些相关特性。按照酶催化反应的类型，将所有的酶划分为六个大类，分别为：①氧化还原酶（oxidoreductase）、②转移酶（transferase）、③水解酶（hydrolase）、④裂合酶（lyase）、⑤异构酶（isomerase）、⑥合成酶（synthetase），且酶类的编号数字与酶的分类一一对应，如第3类酶即指水解酶（表2-1）。

表2-1 酶的系统命名法分类

系统命名法中每一种具体的酶都有一个4位数字系统编号。系统编号的第一个数字表示该酶属于上述六大类酶中的类型，如EC 1.1.1.1中的第一个1表示该酶属于第一类酶，即氧化还原酶。第二个数字表示该酶属于该大类酶中的第一亚类，如EC 1.1表示该类酶以醇作为催化反应的供体，作用于其分子上的CH—OH键。第三个数字表示酶所属的亚亚类，如EC 1.1.1表示该类酶以NAD（+）或者NADP（+）作为催化反应的受体。第四个数字表示该酶在亚亚类中占有的位置，如EC 1.1.1.1表示醇脱氢酶。因此，这四个数字就能确定具体的某一酶。

六大类酶的催化特性差异很大，其主要特性如下所述。

1.氧化还原酶

该类酶催化氧化还原反应，在生物体内主要参与产能、解毒和某些生理活性物质的合成。氧化还原酶主要包括脱氢酶、氧化酶、过氧化物酶、氧合酶和细胞色素酶等，在体外主要用于分析试剂和疾病诊断等。

2.转移酶

该类酶催化化合物上的某一基团转移到另一个化合物上，在生物体内主要参与蛋白质、脂肪、糖类和核酸的代谢与合成。转移酶主要有羰基转移酶、酮醛基转移酶、酰基转移酶、磷酸基转移酶等。

3.水解酶(www.daowen.com)

该类酶催化各种化合物进行水解反应，在生物体内外起到分解的作用。水解酶的种类非常多，常见的有蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶等。目前已有很多水解酶实现了大规模工业化生产和应用。

4.裂合酶

该类酶催化脱去反应底物上的某一基团，形成两种物质，同时还催化该反应的逆反应。裂合酶包括醛缩酶、水化酶和脱氨酶等。

5.异构酶

该类酶催化各种同分异构体的相互转化，包括差向异构、顺反异构、醛酮异构、分子内转移、分子内裂解等反应。异构酶目前应用最广泛、最成功的是葡萄糖异构酶。

6.连接酶

该类酶催化两种化合物合成一种化合物，在生物体中参与很多生命物质的合成，其在催化过程中需要ATP等高能磷酸酯提供结合能，有时还需要金属离子的参与。