（一）蛋白质序列的检索

（1）从NCBI检索蛋白质序（http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db= Protein）。

（2）利用SRS系统从EMBL检索蛋白质序列（http://srs.ebi.ac.uk/）。

（二）蛋白质序列的基本性质分析

（1）蛋白质序列的信号肽分析（http://genome.cbs.dtu.dk/services/SignalP-2.0/）。

（2）蛋白质序列的跨膜区分析（http://genome.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-1.0/；http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html）。

（3）蛋白质序列的亚细胞定位分析（http://predict.sanger.ac.uk/nnpsl/nnpsl_mult.cgi）。

（三）蛋白质序列的同源性分析

（1）基于Blast软件的蛋白质序列同源性分析（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/blast.cgi）。

（2）基于FASTA软件进行蛋白质序列同源性分析（http://www2.ebi.ac.uk/fasta3）。

（3）两条蛋白质序列之间的同源性分析（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/bl2.html）。

（4）蛋白质序列的批量联网同源性分析。

（四）蛋白质序列的结构功能域分析

（1）蛋白序列的motif分析（http://www.isrec.isb-sib.ch/software/PFSCAN_form.html）。

（2）蛋白质的结构功能域分析（http://smart.embl-heidelberg.de/；http://www.ebi.ac.uk/interpro/interproscan/ipsearch.html）。(www.daowen.com)

（五）蛋白质家族分析及其进化树的构建方案

详细可参见http://www.faseb.org/protein/docs/WWWResources.html。

【小结】

蛋白组学的发展离不开其相关实验技术的突飞猛进，这些技术不仅可以进行蛋白质的分离和鉴定，还可以进行目的蛋白的筛选和样品的分析，为生命科学领域相关研究提供了新的思路和解决办法。本章主要介绍了包括免疫印迹杂交、双向电泳等蛋白质组学实验技术的原理、特点，以及这些技术的基本步骤。

【巩固练习】

（1）双向电泳第一向进行胶条水化时的两种方式是什么？各有什么特点？

（2）双向凝胶电泳的基本原理是什么？

（3）western blot 有什么优点？

（4）western blot中抗体的可以重复应用吗？

（5）western blot电泳结果条带形状不好的原因可能有哪些？

【实验小故事】

1979年工作于西雅图弗雷德·哈钦森癌症研究中心的Burnette发明蛋白杂交技术，并定义为“Western Blot”以区别于Southern blot，因为他们实验室正好也处于美国西海岸。Burnette把这个技术方案复印了很多份传给朋友们，很快就开了一个关于blotting技术的电话研讨会，他需要向每一个人解释这个技术，因为很多人拿到复印件之后可能根本读不懂; 那段时间Burnette几乎用所有的时间都在打电话解释他的“Western blotting”技术。通过民间传播这个技术声名远扬，他的文章终于也在1981年被公开发表。

科学的故事总是充满趣味的。