半亩方塘一鉴开，天光云影共徘徊。问渠哪得清如许，为有源头活水来。

如果说朱熹的经济思想尚属鲜为人知的话，那么，他的科学思想则简直是不为世人所知。在以往的中国哲学研究中，传统学术观点认为中国哲学家重伦理而轻科学，其中又尤以宋明理学家更甚。其实，任何一位大哲学家或一种哲学思潮，都是社会科学知识和自然科学知识的概括或总结。朱熹作为南宋时代的大哲学家，亦不例外。

宋代是中国科学技术昌明的时代，随着生产的发展和经济的繁荣，科学技术有了很大的发展。它不仅有世界三大发明的完成（毕昇创造了活版印刷术，比欧洲早四百年；磁针作为指南针，已用于航海；火药被制成“火炮”、“火箭”之类和“霹雳炮”、“大枪”等，已用于军事），提供古代人们从未想到过的许多科学事实；而且在数学、物理、化学、天文、农学、医学以及工艺、纺织技术、火药应用技术，都居世界领先地位。

如北宋贾宪在《黄帝九章·算法细草》中提出开任意高次幂的“增乘开方法”和二项式定理系数表，公元1819年才由英国人霍纳得出“增乘开方法”，十七世纪才有类似二项式定理乘数的“巴斯加三角”；南宋秦九韶在《数书九章》中提出了高次（十次）方程的数值解法，十六世纪时意大利人菲律尔洛才提出了三次方程的解法。(www.daowen.com)

北宋曾公亮编《武经总要》中关于“指南鱼”制作方法，是世界上利用地磁场进行人工磁化的最早记录。沈括在《梦溪笔谈》中已经提出利用天然磁体进行人工磁化以及地磁偏角的问题，而直到公元1492年哥伦布才发现地磁偏角。

此外，在《武经总要》中还载有“火炮药法”、“毒药烟球火法”、“蒺藜火球火药法”等。其法以硫磺、焰硝（硝酸钾）、松脂以及其他不同物质按一定比例制造各种不同用途的火药。北宋时曾进行过五次大规模的恒星位置观测，后由黄裳制成有1440颗星的星图；吕祖谦在金华观测记录24种植物开花结果及黄莺初到，秋虫初鸣的时间，是以实物观测的物候记录，这就使人们对于天体运动规律、宇宙构造、物质结构以及物质之间的联系形式问题的认识，深入了一大步。同时亦出现了总结古代至两宋自然科学成就和科学技术成果的科学著作。

自然科学的蓬勃发展，对于中国文化的发展具有深远影响。于是，学派涌现，群星聚奎。两宋文化的发展，又促进了科学技术的昌明、进步。朱熹的科学自然学说，就是在这样一时代背景下孕育、发展起来的。其中，宇宙自然学说（宇宙论）、天文自然学说（天文论）和气象自然学说（气象论）形成了他的自然科学思想。