（一）蛋白质组学的概念

蛋白质组学（proteomics）的概念于1994年，由澳大利亚麦考瑞大学威尔金斯（Wilkins）和威廉姆斯（Williams）在意大利西耶那的双向凝胶电泳（two-dimensional electrophoresis，2-DE）会议上首先提出，并于1995年7月见刊于电泳杂志。蛋白质组学是以一个基因组、一个细胞、生物体的全部或部分蛋白为研究对象，研究它们在生命活动过程中的存在形式、作用、功能等，从整体角度分析动态变化的蛋白质组成、表达水平与修饰状态，了解蛋白质之间的相互作用与联系，揭示生命活动规律。

（二）蛋白质组学的分类

蛋白质组学按研究目标可分为两大类，即表达蛋白质组学（expression proteomics）与结构蛋白质组学（structure proteomics）。另外，我国学者李伯良提出了“功能蛋白质组学（Functional Proteomics）”的概念，即把“功能蛋白质组”作为主要研究内容。

1.表达蛋白质组学　把细胞或组织中的蛋白建立蛋白定量表达图谱，或扫描表达序列标记（Expressed Sequence Tags，EST）图。此法依赖2-D凝胶图和图像分析技术。

2.结构蛋白质组学　定位蛋白质在亚细胞结构中的位置，通过纯化细胞器或者使用质谱仪鉴定蛋白复合物组成等，从而确定蛋白质的结构或蛋白质-蛋白质之间的相互作用。(www.daowen.com)

（三）蛋白质组学的研究内容

1.蛋白质的表达模式　在生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表达差异蛋白质信息库；蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定。

2.蛋白质的功能模式　蛋白质结构分析；蛋白质之间相互作用、翻译后修饰、细胞定位等。

（四）蛋白质组学的应用与发展

目前研究主要有以下几个方面：癌症、器官移植排异、神经性疾病、心血管疾病、糖尿病、肥胖症等人类重大疾病的临床诊断和治疗。蛋白质组技术前景十分诱人，国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。1996年，澳大利亚建立了世界上第一个蛋白质组研究中心：Australia Proteome Analysis Facility（APAF）。丹麦、加拿大、日本也先后成立了蛋白质组研究中心。2001年4月，在美国成立了国际人类蛋白质组研究组织（Human Proteome Organization，HUPO），随后欧洲、亚太地区都成立了区域性蛋白质组研究组织，试图通过合作的方式，融合各方面的力量，完成人类蛋白质组计划（Human Proteome Project）。国际上蛋白质组研究进展十分迅速，不论基础理论还是技术方法，都在不断进步和完善，多种细胞的蛋白质组数据库已经建立，相应的国际互联网站也层出不穷。