理论教育 DNA斑点杂交法的基本原理及步骤

DNA斑点杂交法的基本原理及步骤

时间:2023-11-04 理论教育 版权反馈
【摘要】:(一)基本原理斑点杂交法是将被检标本点到膜上,烘烤固定。(二)主要步骤1.DNA斑点杂交先将膜在水中浸湿,再放到15×SSC中。将整个细胞点到膜上,经NaOH处理,使DNA暴露、变性和固定,再按常规方法进行杂交与检测。

DNA斑点杂交法的基本原理及步骤

(一)基本原理

斑点杂交法是将被检标本点到膜上,烘烤固定。为使点样准确方便,有多种多管吸印仪(manifolds),如Minifold I和II、Bio-Dot(Bio-Rad)和Hybri-Dot,它们有许多孔,样品加到孔中,在负压下就会流到膜上呈斑点状或狭缝状,反复冲洗进样孔,取出膜烤干或紫外线照射以固定标本,这时的膜就可以进行杂交。

(二)主要步骤

1.DNA斑点杂交

(1)先将膜在水中浸湿,再放到15×SSC中。

(2)将DNA样品溶于水或TE,煮沸5min,冰中速冷。

(3)用铅笔在滤膜上标好位置,将DNA点样于膜上。每个样品一般点50μL(2~10μg DNA)。

(4)将膜烘干,密封保存备用。(www.daowen.com)

2.RNA斑点杂交 与上法类似,每个样品至多加10μg总RNA(经酚/氯仿或异硫氰酸胍提取纯化)。方法是将RNA溶于5μLDEPC水,加15μL甲醛/SSC缓冲液(10×SSC中含0.15mol/L甲醛)使RNA变性。然后取5~8μL点样于处理好的滤膜上,烘干。

整个RNA实验中,要防止激活内源性RNase,有许多种预防措施,有一种是在样品中加入核糖核苷氧矾基复合物。

3.完整细胞斑点杂交 应用类似检测细菌菌落的方法,可以对细胞培养物的特异序列进行快速检测。将整个细胞点到膜上,经NaOH处理,使DNA暴露、变性和固定,再按常规方法进行杂交与检测。有人曾用此法从105个培养细胞中检测到少至5pg的Epstein-Barr病毒DNA。

(三)优缺点

总的来说,这三种方法耗时短,可做半定量分析,一张膜上可同时检测多个样品。

1.RNA斑点杂交中标本处理技术可以简化,不用提取和纯化RNA,用含0.5%Nonidet P40的低渗缓冲液对多种动物细胞作简单处理,离心去掉细胞核和细胞碎片,就得到基本不带DNA而富含RNA的细胞质提取物,这一粗RNA在高盐下用甲醛变性,不需加工直接点到硝酸纤维素膜上。本法可以快速检测大量标本。

2.完整细胞斑点印迹法可以用于筛选大量标本,因为它是使细胞直接在膜上溶解,所以DNA含量甚至比常用的提取法还高,又不影响与32P标记的探针杂交。但它不适于非放射性标记探针,因为DNA纯度不够。

免责声明:以上内容源自网络,版权归原作者所有,如有侵犯您的原创版权请告知,我们将尽快删除相关内容。

我要反馈