（1）酶分子中肽链某一部分的折叠和去折叠激酶-底物复合物形成过程中，将发生许多微环境上的变化，如氢键的形成或断裂等，这种过程在水溶液中较强。酶在有机介质中由于水分的减少，相对来说酶分子的构象表现出比水溶液中更具有“刚性”特点。因而通过选择不同性质的溶剂来调控酶的某些特性成为可能。可以利用“生物印迹”（bio-imprinting）来调控底物专一性、立体选择性和对映选择性。

（2）在适当条件下，可以改变酶促反应的热力学平衡向有利于合成方向进行。因此，可以使用水解酶（主要是蛋白水解酶和脂肪酶）进行酯、聚酯、内酯、酰胺和肽等化合物的合成。

（3）由于引起酶变性的许多因素与水的存在有关，因此在有机介质中酶的稳定性得到显著提高。如猪胰脂肪酶（PPL）在99%的有机介质中100℃保温数10h仍保持较高的酶活性。而在此温度下，酶在水溶液中迅速失活。

（4）由于有机溶剂的存在，水量减少，大大降低了许多需要水参与的副反应，如醋酐的水解、氰醇的消旋化和酰基转移等。

（5）在有机介质中进行的生物催化反应，可以省略产物的萃取分离过程，有利于提高收率。(www.daowen.com)

（6）脂溶性底物和产物在有机溶剂中的高度溶解性，有利于提高底物浓度总的水平。同时由于底物和产物的高脂溶性，它们在酶分子表面的实际浓度较低，可以减少底物或产物对酶引起的抑制作用。

（7）酶在有机溶剂中的不溶性，使它们可以在反应中以固体形式存在，反应后可通过简单的过滤方法回收。

（8）在有机溶剂的存在下，一般不存在微生物污染问题。