1.SP-B分子结构及单分子膜结构模型
目前通过在不同的环境中对SP-B的二级结构进行研究,如有机溶剂、洗涤剂微团、磷脂双分子层和磷脂单分子层。SP-B是由两个SP-B单体通过二硫键相连而成的疏水性二聚体,每个SP-B单体由79个氨基酸残基组成。一个SP-B单体内部含有三个分子间二硫键,并通过三四个两亲性螺旋结构与脂双层结构相联系(如图4-4所示)。许多实验研究表明SP-B优先与脂类膜的表面相作用,并缺少跨膜性质的区域。在大量的独立环境和FTIR光谱技术表明,SP-B包含27%45%(质量分数)的α-螺旋结构以及1%~42%(质量分数)的β-折叠结构。本文假定SP-B含有36%(质量分数)的α-螺旋结构,剩余64%(质量分数)结构为β-折叠结构。根据上述SP-B分子的结构特征,本文提出纯SP-B单分子膜的结构模型(见图4-4)。纯SP-B单分子膜的结构模型与纯SP-C单分子膜的结构模型相似,单分子膜在压缩过程中也经历三个特征状态:无序的LE态(图4-4(a))、有序的LC态(图4-4(b))及崩溃态(图4-4(c))。另外,同样定义三个特征模型参数:LC态瞬时面积ALC、转变面积At及崩溃表面压πmax。
图4-4 纯SP-B单分子膜在压缩过程中的结构模型
(a)无序LE态;(b)有序LC态;(c)崩溃态
2.SP-B结构模型参数At C的理论计算
根据上述SP-B分子的结构特征,可得模型参数ALC的理论估算值。对于一个SP-B单体,假定其二维几何结构为一个矩形(见图4-5)。已知α-螺旋结构的直径为0.96nm,所以矩形的宽约为1.92nm。假定SP-B含有36%(质量分数)的α-螺旋结构和64%(质量分数)的β-折叠结构。α-螺旋结构和β-折叠结构中的每个残基的上升长度分别为0.15nmn和0.31nm。因为β-折叠链具有一定的弯曲度,假定其弯曲成一个半圆,β-折叠链的弯曲度则为(约0.637)。所以SP-B矩形长度通过下式计算得到:(www.daowen.com)
(79×36%×0.15+79×64%×0.31×0.637-1.92)÷2=6.17(nm)
因此,对于SP-B每个残基面积,通过计算可得ALC为0.150nm2。根据Malcolm的研究表明,α-螺旋结构和β-折叠结构中每个氨基酸残基的平均面积分别为0.128nm2和0.168nm2,所以ALC也可通过下式估算得到:
0.128×36%+0.168×64%=0.154(nm2)
此值与本节理论模型计算得到的0.150nm2非常相近。
图4-5 SP-B单体的结构分析图
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