451条cox1基因和cox2基因联合序列经合并后共定义出207个单倍型，其中44个为共享单倍型（shared haplotype），占单倍型总数的21.3%；163个为独享单倍型（private haplotype），占单倍型总数的78.8%（见表2.6）。

种群间共享单倍型统计分析显示（见表2.6），H2共享的种群数量最多，覆盖地理范围最广，包括中国25个地理种群，为全国共享单倍型；其次为H4，包括东部沿海、中部和西部地区的11个种群，无明显的区域差别；H35多聚集在中西部种群，包括长沙、河南、陕西、山西、重庆等8个种群；H15、H20、H50、H54-55、H71、H82显示为4～7个地理种群之间无规律的共享单倍型；H6、H13、H26、H53、H74则为3个地理种群间共享；其余共享单倍型为2个地理种群间共享。日本种群所含单倍型均为独享单倍型，没有与任何种群共享。

种群间共享单倍型地理空间分析表明，东部地区共享单倍型比例最高，浙江嘉兴达到71%。其次为东南沿海地区或是中部地区，百色、广州、余江3个种群共享单倍型比例均大于60%。再次是以西部种群居多的兴义、长沙、长治、云南、汉中、郑州、赫章、信阳、杨凌、上海、武汉和福建共12个种群，共享单倍型比例皆大于50%。共享比例较低的3个种群依次为扬州、兰溪和日本。

表2.6　宽带果实蝇207个单倍型在26个地理种群间的分布及统计
Tab.2.6　The distribution of 207 shared haplotypes and related statistics among 26 Zeugodacus scutellatus geographical populations(www.daowen.com)

续表2.6