目前在调度过程中，河道和水闸不配套的现象十分严重，既有水闸设计不规范、设施老化等问题，更有河道护岸建设滞后，区域防洪控制标准不高等，导致无法有效地进行引排调度。但更重要的是河道的疏浚和水系的贯通，以确保调度过程中水流的通畅，防止底泥等污染物的二次污染。

据调查，全市河道现有淤积总量为1.45亿m3，其中区（县）管以上河道淤积量要占35.03%。全市平均每公里河道淤积量达6678m3，淤积深度一般0.5～0.8m，如果按照河道规划整治断面要求，则全市河道需开挖土方总量2.06亿m3，其中区（县）管以上河道开挖量要占41.43%。可见，河道的清淤和整治开挖任务十分繁重。但作为重中之重的，就是主要骨干河道的畅通，要通过评估分片水资源调度能力和防洪排涝能力为基础，结合城市景观建设，实现主要骨干河道的互连互通，让水能流起来。目前14个水利控制片中问题最为严重的是蕴南片和淀北片，为此上海市水务局在2002年底提出“截污治污、沟通水系、调活水体、营造水景、改善水质”的河道整治目标，并投资17亿元，确保年内开工，年内建成，以初步实现扩大河道过水断面的要求。通过新一轮河道整治，要使各主要水利控制片的骨干河道过水断面与区域引排水能力相匹配，为推进水体的大引大排创造条件。(www.daowen.com)