热处理是一种广泛应用的方法，可以稳定食品性质。加热可以杀死微生物和抑制酶的活力。热烫是一种有效降低蔬菜中酶活性的方法。这种方法通过使酶变性来抑制其活性，但是同时会破坏热敏性成分，因此很少应用在浆果类水果上。热烫处理会造成例如维生素、香味、色泽、质地、碳水化合物和其他水溶性物质的损失。同时，因为对水和能量的大量需求，造成的浪费也是热烫技术的一大缺点。

一般来说，70～90℃的热处理可以破坏酶的催化活性，为达到完全抑制酶活的效果，热处理时间的长短取决于处理的产品。Chutintrasri和Noomhorm对菠萝中PPO热处理研究发现，在40～60℃下处理酶30 min可以使酶活降低大约60%，当处理温度超过75℃时，酶变性程度迅速加快（Chutintrasri and Noomhorm，2006）。在85℃下处理5 min或90℃处理5 min，残余活性分别只剩大约7.0%和1.2%。Napoleon葡萄PPO在30～100℃的范围下处理5 min，70～80℃处理后酶活力仅剩20%，100℃处理后酶活力完全被抑制。维多利亚葡萄中的PPO酶在70℃热处理10 min后，酶活被完全抑制。坚果中的PPO酶活性在70℃热处理30 min后还剩余8%（Xu and Zheng et al.，2004）。从草莓中提取的PPO对热十分敏感，55℃处理10 min可以使酶活降低50%，在65℃处理10 min可以使酶活完全抑制（Dalmadi and Rapeanu et al.，2006）。

考虑到酶在物种间的多样性，在2010年，某试验评估了三个鳄梨品种（Choquete，Fortuna和Quintal）PPO的耐热性，测定活性的方法和Cat酶一致（以儿茶酚为底物，测定395 nm处吸光度），结果显示，不考虑果实成熟度和热处理温度（60～80℃），热处理10 min后，样本平均酶活性降至50%～60%，这表明鳄梨内存在热抗性的同工酶。(www.daowen.com)

对原浆进行热处理，可能造成膜结合的PPO的释放，这在一定程度上抵消了热钝化效应。同时，热处理还有可能激活一些潜伏态的PPO。在组织匀浆中，酶会被其他食品组分如蛋白质、碳水化合物所保护，因此相比于纯化的酶更为稳定。