清王朝建立以后，屯田和移民垦殖活动不如明代那样广泛，但却更加深入了。其在彝族地区的特点，就是填补明代屯田和移民垦殖活动的空白，并进一步向更多的彝族地区推进。这就是说，清王朝在明代移民垦田的基础上，更进一步排挤了彝族的居住区。特别是清王朝采取残酷的军事镇压手段推行改土归流，不但大量屠杀彝族人民，而且迫使许多地方彝族东逃西散，不得不离开祖祖辈辈生活的家园，逃往更远更深的山区。

滇东北及贵州西部地区，历来都是彝族的主要聚居地区之一，从秦汉直到元朝时期，这些地区为彝族阿于歹部（东川）、芒部部（镇雄）、乌蒙部（昭通）、乌撒部（贵州威宁，彝语叫纪俄革）、水西部（彝语叫慕俄革，阿者家）等部所居。清朝时期大规模武力推行改土归流时，朝廷军队在这些地区采取留者杀、逃者杀、妇女儿童皆杀等灭绝人性的血腥屠杀手段，先后杀害了数十万彝族人民，造成了这些地区彝族人口的大量减少。雍正六年（公元1728年），鄂尔泰在镇压米贴（今永善县）彝族人民的反抗中，一次就杀害了3万多彝族人民，使米贴顷刻间变成了死城。

滇东北、滇东南、黔西和黔西南地区彝族人民遭受大杀戮劫难之后，逃脱剩下来的，一部分逃到四川凉山，一部分逃进了更远、更偏僻的深山，一部分则被迫改变民族成分，变为汉族或其他民族。留下的大片土地无人耕种，清政府便采取招募移民的办法，通过清丈田亩，招民垦耕种植。雍正六年（公元1728年），仅东川一地，一次就招募外来户400多户。与此同时，还把大量的良田赐给士兵种植，每个士兵分给30亩。有家属和余丁的，还加倍赏给，并由官府提供耕牛及银两作为购置生产工具费用。雍正九年（公元1731年），继鄂尔泰任云贵总督的高其倬在寻甸招募1000户人家到昭通，将昭通所有的田地分为生、熟、水、旱四种，按每户20亩分给招来户，并划线立碑，颁发执照，永远为其所有。在镇雄，官府则将彝族土司的领地或没收，或变价入官。雍正七年（公元1729年），镇雄变价入官的土地达671顷，折合10065亩，之后还陆续有所增加。这些变价入官的土地，又作价给佃户，永为其有。(www.daowen.com)

雍正六年（公元1728年），在鄂尔泰屠刀下逃脱后渡过金沙江进入凉山的滇东北彝族难民，得到吞都、沙马、雷波、昭觉、阿照、平底等地彝族的援助。鄂尔泰又派兵追击，直入川境五六百里。四川提督黄廷桂也调兵配合追杀。随后在凉山边沿地带，相继设置西昌、越嶲、峨边、马边、雷波等行政机构，又布设由建昌镇统率的冕山营、越嶲营、宁越营、峨边营、马边营，以及泸州镇统帅的普安营、安阜营等兵营，各营又分设若干汛塘，对凉山彝族地区进行严密封锁、控制和镇压，压缩凉山彝族居住区。道光十五年（公元1835年），四川总督鄂山又派兵镇压凉山彝族。镇压行动中，鄂山采取严密包围，分路夹山的罪恶手段，先将彝族人民所种的庄稼全部铲除，断绝彝族人民的养命之粮。对那些逃往深山的彝族，则以重兵长期围困，使之成为饿殍。然后用枪炮加以歼灭，以达到其斩草除根的罪恶目的。同时，鄂山还协调云、贵两省配合，堵截彝族逃亡路线，并焚毁彝族村寨，抢夺财物。三、四月份不让彝族人民播种，八、九月份不让彝族人民收获。在清军灭绝人性的剿杀下，彝族人民被迫向更高、更深的高山密林地区收缩。而在原来的居住村寨，清军又从外地招募移民来耕种，并发给枪械，构筑堡垒，防止彝族反抗攻击。

经过明、清两代的移民和军事镇压后，西南地区彝族居住区格局发生了巨大变化。坝区在明代被军屯侵占，在清代又遭军事镇压之后，迫使坝区彝族人民向山区转移。当时属于临安府的今文山州中西部地区，也难免于劫难。雍正《临安府志》卷七说：临安，元代以前为夷倮居住地，自明代以卫军实其地后，夷倮渐少。康熙《蒙自县志》卷一说：蒙自的土著之民少，而外来之民多，都是明朝迁移而来实边之民。据新中国成立初期1953年的调查表明，自古为彝族聚居的滇池、曲靖、临安、楚雄、武定等地的彝族人口一般都比汉族少，其中，曾经长期是彝族政治、经济、文化中心的晋宁县城，长住的彝族人口只剩下了202人，曲靖城内只有475人。以县来看，最多的元谋县64000人，武定县61986人，弥勒县60000人，禄劝县50000人，石屏县46000人，开远市46000人（包括今砚山县西部），建水县40000人，峨山县40000人，蒙自县38000人（不含原属文山县的老寨乡），路南县35000人，楚雄县（今为市）33000人，南华县31000人，双柏县30000人，都比汉族人口少得多。1953年，文山州（当时为文山专区）的总人口为1302524人（不含砚山县西部的平远、阿舍、稼依三乡镇和丘北县西部的曰者、舍得、官寨三乡镇及双龙营镇西北部，但又含有今蒙自县老寨乡和屏边县部分地区，下同），其中汉族人口573766人，占44.05%；壮族400861人，占30.78%，苗族157442人，占12.09%；彝族113082人，占8.68%。在113082个彝族人口中，文山县（今为市）27673人，丘北县26265人，砚山县22212人，西畴县3026人，麻栗坡县5825人，马关13888人，广南县16741人，富宁县（今富宁县西部的田蓬、木央两乡镇当时属于麻栗坡县）1282人。