东山人、明武英殿大学士黄道周所作《铜山石室记》，记述九仙山“壁立南向，下俯十仞，虽井泉未回，洞壑简鲜，亦灵宰所直，宿真人之游邸也。十仞之下，旧环诸刹，钟磬余铿，浮于木末。左裂石窦，飞泉下滴，夏冬不枯……”文中之言：此山可与天竺、虎丘媲美。铜山石室由几块岩石围成，清幽明净，其中有古代名士在此镌“人世仙境”、“海天一色”、“宝瑶仙峰”等摩崖石刻。距离石室几丈之遥，有一处“瑶台仙峤”的楷书大字石刻。其上为一个可容纳数人的平台，现在围了铁栏杆，为游人登高望远的绝佳去处。驻足于此，极目远眺，但见碧海涌浪，长堤一线，城郭村落，清晰可见。

南明永历年间，国姓爷郑成功曾把铜山作为军事基地，在此屯募军队，制造舰船，操练水师。并在此接受南明永历皇帝赐封“威远侯”。清代江日升的《台湾外记》记载，明永历二年（1648年）：“八月，郑成功在铜山整顿船只，训练士卒……漳浦守将王起俸谋降，事泄，弃家从旧镇（今漳浦县旧镇）入铜山。成功受降，加俸总练使，同柯宸枢联络铜山等处，募兵措饷。”“诏安倒五都（今为东山康美镇）人林日灼鼓众拒之，功令甘辉往征，日灼旋灭。”又载：“十月，江于灿、黄志高同太监刘玉赍永历诏到。晋封成功威远侯，功拜受毕，厚待刘玉。遂兴师从云霄白塔登岸。”明永历十年（1656年）：“七月，成功令黄元、郭华栋二镇领本部将士下铜山，同张进协守。”此外，《闽海纪要》载：“永历三年（1649年），成功屯兵于铜山。”郑氏部将杨英的《从征实录》也有记载：“委忠振伯（洪旭）先到铜山拨船议粮。”

明永历壬辰年的《仙峤记言》石刻(www.daowen.com)

1982年在铜山石室内首次发现的《仙峤记言》石碑，高171厘米，宽69厘米，碑文记载南明永历六年（1652年）郑成功部将洪旭、张进、甘辉等四十三人捐银修建观音堂之事。1661年，郑成功收复台湾时，铜山有500余名青壮年随军赴台，为收复和开发台湾做出贡献。其后，这个水操台成为海峡两岸船只入港的航标和东山县的标志。山下的大澳湾畔，至今尚存一口“万军井”，这是当年为供应郑成功水师饮用水而开凿的。

笔者登上与水寨大山遥遥相对，约有一箭之隔的龙潭山，这里有一个高约3米的不规则岩洞，相传为郑成功住宿、办公的营房，附近还有粮埠的旧址。岩洞洞口刻有“云坞”二字，为阴刻行书，落款为“辛丑年孟春鹤浦张日辉书”。此为明永历十五年（1661年）郑成功部镇守铜山的主将、忠匡伯张进的长子张日辉所书。郑成功部队留存的军事建筑遗址除了“云坞”石洞外，还有位于今铜陵镇中山公园的“军藏局”、位于岛东部康美镇的康美城堡、位于岛西北部的八尺门城堡。这些遗存印迹无不佐证了郑成功曾经屯兵水寨大山，把铜山作为重要的军事基地。