据《漳浦县志》记载，六鳌在宋代属安仁乡含恩里，元代设青山巡检司城，明代属十五都。明洪武二十一年（1388年）设六鳌守御千户所。隶属镇海卫。因六鳌城临海筑城，建于青山的山腰，状如“巨鳌载岳”，此后青山亦改称“六鳌山”。

六鳌古城依山势地形起伏，筑于天然岩石上。城墙全部采用花岗岩条石砌筑，周长约1815米，高约6米，宽约3米，略呈环三角的不规则圆形。古城东面以海为濠，开设西、南、北三个城门，各门夯筑土城楼。另辟有排水的水门，今仍可见东、西面有五个水门，水门既用于排洪又可用于战时应急。此外，城中还筑有施放烽烟报警的墩台和观察海上敌情的观察台。作为军事要塞，六鳌千户所与东北的镇海卫、西南的铜山千户所和悬钟千户所并列在漳州境内的海岸线上，互为犄角，声息相通。六鳌千户所处在这条联防线上的中点，守卫着漳浦县的大门。

史志的记载虽然是平面的，但对于了解六鳌却是必不可少的。六鳌守御千户所的人口属于军籍，明代以来在抗倭斗争中发挥了自身的防卫作用。明嘉靖年间，海防松懈，倭寇长驱直入内地劫掠。嘉靖末年，名将戚继光、俞大猷从浙江入闽剿平倭寇后，戚继光留下一部分军队戍守福建海防，其中一营官军驻扎在六鳌城外，史称“浙兵营”。(www.daowen.com)

清代取消军籍，实行保甲制度，六鳌半岛于清顺治年间设六鳌、龙澳二保。康熙元年（1662年）“迁界”，沿海居民被迫内迁，部分渡海到台湾依附郑成功政权。至康熙十八年（1679年）“复界”，许多居民都没有回归六鳌，古城的人口因此大减。

康熙三十九年（1700年）重新编定保甲，六鳌、龙澳二保并编为龙鳌一保。以后，旧镇、深土一带许多人迁到六鳌定居，六鳌半岛的人口才逐渐多起来。民国初年划为六鳌里（当时开始将“陆鳌”简写为“六鳌”），初属东区管辖，后划属第一区（区署设在旧镇）。幸运的是，在历次的政治动乱、战火兵燹等人为破坏中，六鳌古城的城墙仍然保存完好。今天的六鳌古城，随处可见一棵棵参天古榕，枝叶繁茂。古榕树和古城墙相依相守，共同见证流逝的岁月。