距浯屿码头50米开外，有一座古香古色的砖木宫殿式建筑——天妃宫，俗称妈祖庙。据传该庙由原南山寺僧、浯屿人徐世昌倡建。初以宋宣和四年（1122年）宋徽宗赐庙额“浯江”为名，也称浯江庙。元代至元十五年（1278年）、十八年（1281年），元世祖两次册封妈祖为天妃，浯江庙随之易名为天妃宫。

清康熙年礼部郎中雅虎致祭妈祖的匾额

据96岁高龄的林山场老人介绍，浯屿人莫不以岛上这座天妃宫为荣，老一辈的浯屿人尤以和庙中的妈祖像合影为幸事。一者妈祖文化深入民心，其褒扬忠烈、崇高孝悌、救苦救难、庇护渔家等品德，对浯屿民风民俗影响深远；二者浯屿妈祖历史上有其神秘之处，其他地方的妈祖庙，殿堂柱子只能雕绘四爪金龙，唯独浯屿妈祖庙可以雕刻五爪龙、用黄色琉璃瓦。这是因为在海防史上浯屿妈祖有过特殊的功劳，当朝皇帝给予的特别奖励。

清康熙二十四年（1685年）一月十四日，福建水师提督施琅将军，曾奏请康熙皇帝御赐褒奖浯屿妈祖，其奏章至今还高挂在庙堂之上。奏书上称：“前奉旨征剿台湾，师次平海澳。在天妃庙之左有一井，往常雨顺井水日不能资百口。遣人淘浚，泉忽大涌，足供四万余众。及澎湖鏖战之日，平海之人俱见庙中神像衣袍透湿，知为助战，乃以神灵显助破逆。”康熙皇帝为此还下旨命礼部郎中雅虎等大臣到浯屿祭拜妈祖，如此殊荣，果不寻常。妈祖是否显灵为施将军助战，无须考证。在这个动人的传说里，我们可以确信的是，施琅平定台湾，曾经在浯屿驻扎过他的龙虎之师。(www.daowen.com)

在妈祖庙的左右两侧各有一口井，两井深约十余米，井壁以红砖砌成，苔色斑驳，井口直径约2米。奇怪的是右井已经干涸见底，而左井井水甘甜毫无咸涩，其甘泉如今成了岛上人家的自来水水源，滋润这后代子民。左井当是史实中的“井”，当年这口勉强才够岛上几百人用的水井，一下要供应4万多的兵马，确实让人难于想象。为了纪念这段传奇的历史，后人把这两口井称为龙虎井，左青龙右白虎，龙脉尤见而虎煞无存，正应验了今日浯屿水寨的现实。

浯屿清道光年间的《新筑营房墩台记》古碑