投入是影响水土保持小流域综合治理水平和效果最直接、最重要因素。按照“政府投入高中求增，依法收费稳中求足，群众投入变中求稳，市场融资活中求多”的思路，以重点工程为纽带，多方筹集资金，应建立多元化、多层次、多渠道的投入机制。

（1）加大政府财政投入力度。加大中央和地方财政投入力度，提高用于水土保持生态建设部分财政投入在国民经济收入中所占的比例，提高单位面积治理经费，以“允许水土流失量”为标准核算单位面积资金投入量，以保证合理有效的水土保持资金投入。各级政府应把水土保持列入基本建设计划，纳入各级财政预算，建立比较稳定的资金渠道；建立水土保持专项基金，逐年增加，滚动发展。

（2）积极拓宽投入渠道。争取政策从矿产、水电等资源开发的收益中提取一定比例的资金用于企业所在地环境的恢复治理，拓宽水土保持生态建设投资渠道，加快水土流失防治步伐。对“四荒”资源和中小型水利水保工程本着“谁投资、谁经营、谁受益”的原则采取拍卖、租赁、承包、股份合作等形式，扩大水保投资途径。东营市从改革融资机制入手，制定出台一系列优惠政策，每年吸纳社会投资生态水利建设资金5000多万元，走民营投资水利水保的路子。民营投资景观水利、生态水保在东营已成为新热点。(www.daowen.com)

（3）加强资金的科学监管和使用。强化综合性水土保持规划的约束力，整合各渠道的资金投入，并建立严格的资金管理和使用机制，通过相关法律法规加以约束和监管，保证水土保持资金在筹集、流转、管理和使用等一系列环节中的合法性、有效性。具体而言，从项目主管部门到基层实施单位，从上到下，层层建立专项账户，严格经费预算的审批、使用和监督，严格保证群众水土保持补助费的到位和足额发放。同时，进一步加强和改进水土保持工程项目的“三制（项目法人制、招标投标制、项目监理制）”，促进水土保持项目实施过程中责、权、利的统一，提高资金的使用效率，降低治理成本。充分借鉴和推广世界银行贷款项目中严格而有效的经费管理和报账制度。