不断完善立法体系，保持法规的一致性和协调性。流域性法律法规体系包括全国性法律，跨省级行政区的流域性法规以及地方性流域行政法规。当前应优先修改各级法律法规之间的不协调，尽快制定和完善流域性专项法规和管理条例。建立实施流域综合管理的法律法规体系，在国家层面上制定有关的流域性法律法规，将流域综合管理的理念纳入到相关法律法规和各类规划中。明确流域管理立法的指导思想；确立流域管理的立法模式；建立健全流域管理法律体系；制定专门的各大江大河流域管理法律法规；建立健全相关的流域管理配套法律法规。

（1）在全国性法律法规建设方面，主要应修改完善《水法》、《水土保持法》、《环境保护法》、《水污染防治法》、《防洪法》、《渔业法》、《自然保护区管理条例》等法律法规中有关流域管理的相关条款，减少包括管理体制、流域管理机构职能等在内的法律间相互冲突的地方，增加相互关联性，以适应流域综合管理的需要。

（2）在跨省级行政区流域法规方面，应制定和修订各流域管理的法规，如《淮河流域水污染防治暂行条例》等，同时提高流域性法规与专项法规和地方性法规的协调性，并把流域机构的改革作为法律规定的重要内容。(www.daowen.com)

（3）在地方性流域行政法规建设方面，重点制定和修订一级支流和相对独立河段的法规，如《江西省鄱阳湖湿地保护条例》等。

应该指出的是，法律法规并不是越多越好，欧盟在制定《欧盟水框架指令》时就提出要精简法律。因此，应在已有的法律框架下研究相关流域性法规设置的必要性，避免立法和执法中可能存在的冲突。