该船布置设计本着恢复郑和宝船原外貌，坚持实用、美观、舒适、方便的原则。船舶风格为仿古形式，设有落舱式甲板室。

在舱底#0—#28设29道水密舱壁，将主船体分为29个舱室，自尾至首依次为：尾部—#0空舱、#0—#1为竹木炭舱、#1—#2为淡水舱、#2—#3为蔬菜舱、#3—#4为粮舱、#4—#5为桅舱、#5—#7为兵器库、#7—#9为货舱、#9—#10为桅舱、#10—#14为货舱、#14—#15为桅舱、#15—#17为货舱、#17—#18为家畜室、#18—#19为贡品收藏室、#19—#20为桅舱、#20—#21为货舱、#21—#22为赐品收藏室、#22—#23为淡水舱、#23—#25为兵器库、#25—#26为桅舱、#26—#27为竹木炭舱、#27—#28为桅舱、#28—首部为锚缆舱。

下甲板的甲板室由于层高过高（4 m），更为了加大货舱容积，故先在舱室内铺一层货物，而士兵和水手居住在货物之上。从尾至首依次设有：尾部—#0为操舵间和舵工居住室，#0—#4两侧为士兵居住室和高级船员居住室、中间布置厨房，#5—#7为客货舱（可作为士兵居住室），#7—#9两侧为客货舱（可作为水手居住室）、中间为大开口、开口周围布置活动栏杆，#10—#14、#15—#19、#20—#24为客货舱（可作为士兵居住室），#24—#25为客货舱（可作为水手居住室），#26—#27为客货舱（可作为钌手居住室）、中间为大开口、开口周围布置活动栏杆。#5—#7、#23—#24，中间以布帘的隔断横向进行分割，避免统舱过大。

主甲板的甲板室，从尾至首依次设有：尾部—#0为阿班、斗兵居室、钌手居室和直库居室；#0—#6，左侧分别设鸿胪寺卿及侍卫长居室、书手居室、译字居室、买办居室、航行设备储物间、百户居室和总管居室；右侧分别设医务室、医官居室、火长居室、阴阳生居室、千户居室、百户居室和储物间；中部分别设正（副）指挥使居室和议事厅。#6—#25为露天甲板，其中部是3道主桅，中部自前而后设置长大的舱口，是人员上下通道和主桅安装施工的必要场地。#25—#27为水手居室和头锭居室，#27—船艏为起锚舱。(www.daowen.com)

尾楼甲板的甲板室，从尾至首依次设有：尾部—#3，左侧分别设侍卫室、神室和副使居室；右侧分别设厨房、餐厅和副使及将官餐厅；中部设郑和居住室、书房和中堂会客厅。#3—#5为进厅兼针房。

尾部露天甲板上设天妃宫，宫前设2旗杆。

宝船设9桅12帆。布置形式由首至尾依次列7道，共9桅，其中中部是3道主桅，首、尾露天甲板上各设2道副桅并各自分别向首、尾外倾，第2和第6道为双桅。