从河源到林芝县的派区，河段长1561千米，水面落差2710米，平均坡度1.7‰。河源段称马泉河，发源于喜马拉雅山中段北坡的杰马央宗冰川，海拔高度5590米。在河源区多冰碛湖，湖多与河流串联在一起。从河源到萨嘎县，海拔4500米～4800米，河谷平宽，两岸为第四纪沉积物，曲流发育，河道散漫，沼泽和湿地有广泛的分布。区内干旱少雨，人烟稀少，为广阔的高原牧场。从萨嘎县到派区海拔降到2800米～4500米之间，河谷宽窄相间，宽坦的谷地、盆地与峡谷相接，顺江而下，有大竹卡峡谷段、泽当峡谷段和加查峡谷段。峡谷段谷底宽度一般100米左右，水面宽50米，峡谷长40千米～300千米不等，水流急湍，落差大，水能资源十分丰富。其中以加查峡谷最为著名，它长37.2千米，水面宽仅30米～40米，两岸山体陡峻，高出水面500米以上，水面落差270米左右，平均比降7.26‰，在僧和湟尔喀形成相对高差4.6米和5.3米的跌水。较大的河谷平地由阶地和河漫滩组成。日喀则宽谷段、曲水宽谷段、林芝宽谷段，谷宽2千米～3千米，最宽处可达6千米～7千米，水面坡降都在1.0‰以下，水流平缓，江中浅滩、沙洲、汊流很多。这些宽谷段是西藏高原主要的农业区。干流挟带的泥沙和各种沉积物，在冬半年西风急流和山谷环流叠加的条件下，使河谷风沙地貌十分发育，沿干流河谷呈带状不连续分布。在桑木张—里孜（河长188千米）和里孜—派（河长1340千米）的各宽谷段内沙丘成群分布，其中以发育在谷坡上的爬什沙丘最具特点。本段主要支流有年楚河、拉萨河、帕隆藏布和尼羊河。

年楚河发源于喜马拉雅山脉中段北麓，习惯上把发源于桑旺湖的涅如藏布称为主源，海拔5150米，在与巴涌曲汇合后先向西流经索郎山后折向北流，穿越宽谷与峡谷相间的谷地，在日喀则下游4千米汇入雅鲁藏布江。河口海拔为3828米，上游河段长74.6千米，平均坡度11.3‰，为宽阔的冰川谷地。中游，河段长39.7千米，平均坡降为6.4‰，主要为峡谷山地。下游河段长102千米，平均河床坡降约2.2‰。河宽谷平，是雅鲁藏布江流域的主要河谷平原之一，也是西藏青稞、小麦和油菜的主要产区。

拉萨河发源于念青唐古拉山中段南麓，河源在嘉黎县麦地卡东面，是广阔平缓的沼泽湿地。

河源高程5200米。河流上游，河段长约256千米，河床平均坡降3.7‰，河谷多为丘陵宽谷盆地。中游河段长138千米，河床平均坡降2.6‰，河谷开阔，有明显阶地发育。下游河段长1565千米，河床平均坡降1.9‰，河谷宽达1千米～5千米，河流迂回曲折，多汊流，在拉萨附近河谷宽7千米～8千米。拉萨河流域是西藏主要的工农业基地之一，自治区首府拉萨市位于河流下游。(www.daowen.com)

帕隆藏布由两大支流组成，东支称帕隆藏布，西支为易贡藏布。帕隆藏布发源于阿札贡拉冰川，由南向北流过安贡湖、然乌湖后，进入高山峡谷区，两岸山峰海拔在4500米～5000米，水面高程3300米～3800米，相对高度达1000米以上，河道平均坡降在10‰左右，河面宽30米～80米。易贡藏布发源于嘉黎西北的念青唐古拉山脉南麓，河源高程5000米，河流由北向南流，河谷不宽，不时穿流在高山峡谷之中，在到达八盖后注入易贡湖。

易贡湖是1900年由扎木弄巴特大泥石流阻塞而成，湖长15千米～18千米，最大宽度2千米～5千米，洪水期湖面积可达20多平方千米。河流出湖后，河床急剧下切，在抵通麦19千米内落差达190米。帕隆藏布在纳入易贡藏布后，折向南流，注入雅鲁藏布江。帕隆藏布和易贡藏布是雅鲁藏布江径流最丰富的河流。尼羊河发源于海拔约5000米的山间湖盆区，河源为拉木错，由西南向东流。上游河谷受两岸山体约束时宽时窄，宽谷中有阶地发育，以牧业为主。中游河段长125千米，河床平均坡降为3.4‰，河谷较宽，为1千米～3千米，是西藏主要工业区。下游河段长36千米，平均坡降2.2‰，河谷进一步展宽可达8千米，形成河谷平原，河道摆动性大，水流紊乱，多江心洲，是主要农业区。