中国高等教育按照学历层次分，可分为高职高专教育（专科教育）、本科教育、研究生教育（硕士、博士） 层次。高等教育投资支出的层次结构也相应地分为三个层次。因为部属、省属、地方所属各类院校的性质不同，经济发达地区与相对滞后地区的经济实力差异，高职高专、本科教育和研究生教育的生均教育支出存在较大差异，无法进行准确的计算分析。根据郎益夫（2007） 的研究，我们假定高职高专、本科教育和研究生教育三个层次教育的生均教育支出比例为0.7 ∶1 ∶2^[4]，则可以得出以下分析情况，具体比例数据如表3-6 所示。

表3-6　高等教育投资支出的层次结构分析

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资料来源：《中国统计年鉴》 1998—2006 年。

从上述数据可以看出，在高职高专层次，中国高等教育投资从1997 年至2002 年一直在31.52%～39.46%之间徘徊，但未超过40%； 2003 年，高等教育投资支出在这一层次首次达到40%以上，2004 年、2005 年也分别达到42.20%、43.08%。这种趋势反映中国高职高专教育支出一直占到了高等教育投资总额的三分之一左右或以上，随着国家教育改革的深入推进，高新技术产业发展的强劲需求，高职高专教育越来越受到重视，支出比例呈现一定的上升趋势。本科教育层次一直是中国高等教育投资支出的主要方向，支出比例在1999 年达到最高的63.07%，从2000 年开始，本科教育层次的投资支出比例逐步呈现下降趋势，2005 年仅为51.29%； 这也反映了高等教育投资在层次上仍以本科教育为主渠道，但总体比例已出现下降。在研究生教育层次，中国高等教育投资支出比例一直相对较为稳定，均保持在5% ～6%，其中2000 年仅为5.14%，2005 年达到5.64%，2000 年以后呈现稳定的、小幅的增长趋势。从以上分析可知，中国高等教育投资支出虽然不同年份在不同学历层次之间有所消长，但总体仍然较为平稳，本科教育一直是高等教育投资支出的重点，但支出比例已经有所下降，高职高专教育支出比例则呈现上升趋势。