PageRank计算可利用Sci2工具来操作。但是，会有一些困难。因为Sci2工具0.5.2版本的一个缺陷，想要在这一版本中基于加权网络计算PageRank是不可能的。最新发布的版本可以计算，但这些版本又不支持创建期刊引文网络所需的数据库插件。考虑到这些困难，我们选择MATLAB执行PageRank计算。

首先，我们需要在MATLAB中加载期刊引文网络。执行如下步骤：

（13）在文本编辑器中打开创建的Pajek网络文件。

图4.2　步骤（8）～（13）的屏幕截图（使用Sci2工具建立期刊引文网络）

（14）搜索“*Arcs”行，拷贝这一行下的所有行到剪贴板。

（15）启动MATLAB。

（16）把剪贴板内容粘贴到MATLAB工作区。确保是一个矩阵而不是多列向量。矩阵卷标是cit。

（17）在MATLAB命令窗口，输入如下命令：

n＝max(max(cit(：，1：2)))；

C＝sparse(cit(：，2)，cit(：，1)，cit(：，3)，n，n)；

这些命令创建一个期刊引文矩阵C。矩阵中的元素C（i，j）表示从期刊i到期刊j的引用数量。

在MATLAB中加载期刊引文网络后，基于网络就能计算PageRank了，采用后续步骤：

（18）创建一个MATLAB函数calc-PageRank。相应代码如图4.3所示。将此代码保存到calc_PageRank.m的文件中。

图4.3　calc_PageRank函数的MATLAB代码

（19）将calc-PageRank.m文件保存的文件夹设置为MATLAB当前文件夹。

（20）在MATLAB命令窗口，输入如下命令：

p＝calc_PageRank(C，0.85，100)(www.daowen.com)

PageRank计算马上执行。阻尼因子参数设置为0.85，幂方法循环的次数设置为100。通常执行100次循环足够得到准确的PageRank值。当PageRank计算完成后，其结果保存在MATLAB工作区的向量中。向量的元素p（i）表示期刊i的PageRank值。图4.4提供了步骤（14）～（21）的屏幕截图。

使用步骤（13）创建的Pajek网络文件，MATLAB计算的PageRank值能被链接到期刊名称。对我们收集的103种Information Science和Library Science期刊，期刊名称和对应的PageRank值保存在文本文件中，可从www.ludowaltman.nl/pagerank/LIS_journals.txt下载。PageRank值最高的10种期刊在表4.1中列出。我们强调所计算的PageRank值对期刊规模是敏感的。在其他条件相同的情况下，有更多出版物的期刊也有较高的PageRank值。为了修正期刊规模，一种期刊的PageRank值需要除以期刊的出版物数量。我们也注意到图4.3中的MATLAB代码，每种期刊在“teleportation”情况下被选择的可能性是均等的。更复杂的方法会把期刊被选择的概率与期刊的出版物数量对应，正如4.3节Eigenfactor方法中所讨论的。☞

图4.4　步骤（14）～（21）的屏幕截图（使用MATLAB计算PageRank）

表4.1　Information Science and Library Science领域PageRank值最高的前十种期刊

续表

注：表中右侧的PageRank值已被乘以100。

总结

在这一章，我们主要讨论了引文分析中PageRank相关方法的使用。首先解释了Brin和Page（1998）以及Page等（1999）提出的用于Web页面排序的原始PageRank方法。然后综述了用于引文分析的PageRank相关方法，从早期Pinski和Narin（1976）所做的工作到最近受1998年提出的PageRank启发的一些方法。在讨论最近的研究时，我们将其划分为用于期刊、作者和出版物引文网络的PageRank的相关方法。在本章的第二部分，我们详细说明了如何综合应用两种软件工具Sci2和MATLAB来计算PageRank。在使用说明中，我们演示了基于Web of Science数据库获得的书目数据来计算PageRank值。作者和独立出版物的计算与此类似。

【注释】

[1]L.Waltman，Centre for Science and Technology Studies，Leiden University，Leiden，The Netherlands，E-mail：waltmanlr＠cwts.leidenuniv.nl；E.Yan，College of Computing and Informatics，Drexel University，Philadelphia，PA，USA，E-mail：erjia.yan＠drexel.edu.

[2]在引文网络环境中悬点问题的实证分析可参见Yan和Ding（2011a）。

[3]在引文网络环境中，除了设置阻尼因子参数值为0.85外，有时也设置为0.5。更深入讨论可参见Chen等（2007）。

[4]http：//wiki.cns.iu.edu/display/SCI2TUTORIAL/3.2＋Additional＋Plugins。

[5]http：//wiki.cns.iu.edu/display/SCI2TUTORIAL/3.4＋Memory＋Allocation。