本章的余下内容将关注从发表在《科学计量学》文章中抽取的无权合作者关系、文章引用和作者引用网络。《科学计量学》是科学计量领域的主要专业期刊，于1978年创刊。例子中的书目记录是从Web of Science下载的2003—2013年的数据。数据集中共有1644篇文章。

我们基本使用Pajek（版本3.08）描述分析过程，用Sci2（版本1.0 alpha）来抽取网络、计算PageRank和进行网络可视化。然而多数任务也能利用Sci2完成，Pajek的优势在于有一本参考书（deNooy，Mrvar，Batagelj，2011），书中不仅介绍主要的社会网络分析概念，而且提供如何获得这些结果的操作说明。

一旦从Web of Science以500为批量下载了记录，合并为一个独立文件，然后使用File＞Load...命令加载到Sci2（见图3.2）。在数据被上载之后，关于其细节将在Data Manager区域显示。

下一步是网络的抽取。所有的网络都能使用Sci2中的Data Preparation命令组。对于协作网络，我们需要抽取合作者网络（见图3.3）。在弹出窗口选择“isi”文件格式。我们也使用Extract Paper Citation Network来创建引文网络。请注意使用Sci2抽取的文章引文网络的链接方向不同于我们通常使用的软件的情况。也就是说，由Sci2抽取的文章引文网络中，链接的方向是从被引文章到引用文章，显示“文章B被文章A引用”的关系，而不是通常的“文章A引用文章B”。

一旦网络被创建，它会显示在Data Management区域。保存网络，可选择“Extracted Co-authorship network”并点击右键，然后选择Save选项。在弹出窗口选择输出文件类型为Pajek的.net格式（见图3.4）。

图3.2　使用Sci2加载数据

图3.3　在Sci2中抽取网络

图3.4　以Pajek的.net格式保存所抽取的网络(www.daowen.com)

在Pajek中打开网络可点击File＞Network＞Read选项，或者点击在网络行上的Read按钮（见图3.5）。

图3.5　在Pajek中打开文件

一旦网络被成功打开，它将显示在Networks区域。在Pajek中能打开多个网络。使用下拉菜单可选择合适的网络。一旦网络文件被打开，为了得到网络的基本属性，在网络的Report界面下选择Network＞Info＞General，并在弹出窗口维持默认值（见图3.6）。

图3.6　在Pajek中得到网络属性的报告

报告（见图3.7）提供了节点和链接的数量、网络密度及平均节点度等信息。

图3.7　显示网络属性的Pajek报告窗口