蕲年宫之变前，嫪毐集团与吕不韦集团关系已非常恶劣，这一点各种史料记载基本一致。《史记》卷六《秦始皇本纪》和卷八五《吕不韦列传》极力渲染蕲年宫之变前嫪毐的权势，这种权势无疑会导致其与相国吕不韦的矛盾。《战国策》卷二五《魏策四》“秦攻魏急”条载：

秦攻魏急。或谓魏王曰：“……秦自四境之内，执法以下至于长挽者，故毕曰：‘与嫪氏乎？与吕氏乎？’虽至于门闾之下，廊庙之上，犹之如是也。今王割地以赂秦，以为嫪毐功；卑体以尊秦，以因嫪毐。王以国赞嫪毐，以嫪毐胜矣。王以国赞嫪氏，太后之德王也，深于骨髓，王之交最为天下上矣。秦、魏百相交也，百相欺也。今由嫪氏善秦而交为天下上，天下孰不弃吕氏而从嫪氏？天下必合吕氏而从嫪氏，则王之怨报矣。”^[36]

魏国上下已知嫪毐、吕不韦势同水火，嫪、吕矛盾可称得上举世皆知。与嫪、吕矛盾相比，嫪毐、帝太后集团与华阳太后为代表的楚系外戚集团矛盾即使存在，也基本无足轻重。(www.daowen.com)

在蕲年宫之变中，嫪毐与吕不韦的立场不会一致，这一点在史料中也有反映。《史记》卷八五《吕不韦列传》载：“秦王十年十月，免相国吕不韦。及齐人茅焦说秦王，秦王乃迎太后于雍，归复咸阳，而出文信侯就国河南。”^[37]嫪毐集团被镇压，帝太后与吕不韦因受嫪毐牵连而分别受到处理。但不久后，茅焦游说秦王政，结局发生了戏剧性的变化。秦王政幡然悔悟，迎回太后，重尽孝道，而吕不韦的情况则直转而下，先是被赶出咸阳、就国河南，不久又被迫自杀。茅焦究竟有什么力量能如此扭转秦王政之心意？马非百认为是出于母子天性之爱，^[38]显然失之于简单。郭沫若认为：“茅焦所以解说于秦始皇的，一定是替太后与嫪氏洗刷，而对于吕氏加以中伤。”^[39]其说虽不无道理，但凭借茅焦一区区齐人之舌能轻易扭转秦王政之内心，仍有可疑。更大的可能是茅焦所说正是秦王政所想，或者茅焦只是秦王政的台阶。通过秦王政对帝太后和吕不韦处理态度的差异，我们也可判断嫪毐与吕不韦在蕲年宫之变中的角色绝不一样，两者的对立关系是毋庸置疑的。