民国二十六年七月，平津陷于倭寇，北方各大学南迁。北京大学、清华大学、南开大学，奉教育部命迁于长沙合组新校，定名为长沙临时大学。以北京大学校长蒋梦麟，清华大学校长梅贻琦，南开大学校长张伯苓，湖南教育厅厅长朱经农，湖南大学校长皮宗石，及教育部代表杨振声等为临时大学筹备委员会委员，以蒋梦麟、梅贻琦、张伯苓为常务委员，杨振声为秘书主任，于十一月一日筹备就绪。理、法商、工三学院，在长沙韮菜园圣经学校，文学院在南岳圣经学校分别上课。迄年终，首都沦陷，武汉震动，乃西迁滇。大部员生步行。于二十七年二月二十日离长沙，四月二十八日到昆明，并奉教育部命，改校名为国立西南联合大学，仍由三校校长为常务委员主持校务，于五月四日恢复上课。租借蒙自海关、法国领事署及法国医院旧址等地为文、法商两学院校舍。租借昆明西门外昆华农业学校为理学校院舍，并租借昆明拓东路迤西会馆、全蜀会馆为工学院校舍，总办公处则设于城内崇仁街四十六号。同时在城西北三分寺附近购地一百二十四亩四分五厘建筑校舍。是年夏以文、法两学院远在蒙自，管理不便，又以空军军官学校在蒙自设立分校，需用校舍。乃将文、法学院迁回昆明。又奉教育部命，增设师范学院，因又增租昆明西门外昆华师范学校、昆华工业学校，并向云南省政府商借城内昆华中学南院、北院为校舍，师范学院即设于昆中北院，以南院为女生宿舍。文、理、法商三学院分在农校工校等处上课，总办公处因崇仁街地址狭小，迁设于才盛巷二号，二十八年春，复为办事便利计，迁至昆华工校。是年夏，新建校舍落成，勉敷文、理、法商三学院之用。时文、理、法商、工、师范五学院共设中国文学，外国语文学，哲学心理学，历史学，算学，物理学，化学，生物学，地质地理气象学，法律学，政治学，经济学，社会学，商学，土木工程学，机械工程学，电机工程学，航空工程学，化学工程学，（按：以下为师范学院各系）国文学，英语学，史地学，公民训育学，算学，理化学，教育学等二十六系。并恢复各科研究所，仍由北大、清华、南开，分别办理，以存三校之旧。计设：

（壹）文科研究所：（一）中国文学部：（1）语言文字组（清华）、（2）文学组（清华），（二）外国语文部（清华），（三）哲学部（清华），（四）历史学部（清华），（五）史学部分（北大），（六）哲学部分（北大），（七）语言学部分（北大），（八）中国文学部分（北大），（九）考古学部分（北大），（十）人类学部分（北大）。

（贰）理科研究所；（一）算学部（清华、北大、南开），（二）物理学部（清华、北大），（三）化学部（清华、北大、南开），（四）生物学部：（1）动物学组（清华、北大），（2）植物学组（清华、北大），（3）昆虫学组（清华），（4）生理学组（清华、北大），（五）地学部：（1）地质学组（清华），（2）地理学组（清华），（3）气象学组（清华），（六）地质学部（北大），（七）心理学部（清华）。

（叁）法科研究所：（一）法律学部：（1）中国法律史及中国法律思想史组（北大），（2）国内司法调查组（北大），（3）犯罪学组（北大），（二）政治学部：（1）国际法组（清华），（2）行政组（北大），（3）国际关系组（北大），（三）经济学部：（1）经济理论组（清华、北大），（2）国际经济组（清华），（3）财政与金融组（北大），（四）社会学部（清华）。

（肆）商科研究所：（一）经济部：（1）经济理论组（南开），（2）经济史组（南开），（3）农业经济组（南开），（4）工业经济组（南开），（5）统计学组（南开）。

（伍）工科研究所：（一）土木工程部：（1）水利工程组（清华）；（2）结构工程组（清华）。（二）机械及航空工程部：航空工程组（清华）。（三）电机工程部：（1）电力工程组（清华）；（2）电讯工程组（清华）。嗣后工学院又添设电讯专修科，师范学院附设初级部及专修科。二十九年夏，工校租约届满，迁总办公处于昆中南院。是时安南屈服于倭寇，云南戒严，奉教育部命于四川叙永筹设分校，置一年级生于分校上课，以备万一。是年冬，昆中南、北两院被敌机炸毁，复将师范学院迁入工校，总办公处迁至新校舍。三十年夏，以昆明局势稍定，复将叙永分校结束，另租昆华中学新校址一部，为一年级生课室及宿舍。八月中，新校舍又遭敌机轰炸，旋赶即修复，十月初，仍得按期上课。三十一年以后，因空袭渐少，省立各校，陆续迁回昆明，以前所租各学校校舍多被索回，仅留昆华工校一部为师范学院校址。(www.daowen.com)

自此以后，各院校址，大致确定。工学院始终设于拓东路迤西、全蜀及江西三会馆内。二十八年后，文、法商学院设于新校舍北区，理学院设于新校舍南区。自总办公处迁入新舍后，全校重心，亦移于此，总图书馆亦设于此，阅览室可容八百人。拓东路工学院分馆阅览室，系一会馆大殿改造，可容四百人。师范学院分馆，可容二百人。分设于各学院之专门期刊室，每室可容三五十人不等。所有书籍大部分系三校藏书迁运来滇，合供本校利用。其余系在湘滇就地采购及由外国购来或经外人赠送者。理工方面设备，本校成立时，曾得中华教育文化基金董事会补助十万元，又管理中英庚款委员会补助二十五万元，用于理工设备者，约二十万元。是时物价尚未上涨，海外交通未受阻隔，本校得以购备急需之物品。嗣后三校运滇之仪器机械，亦有相当数量。加以本校历年经常费内陆续增购者，以较三校原有设备，虽相去甚远，尚能勉敷教学之用。各系实验室，自新校舍落成后，亦粗具规模。工学院学生所需实习工厂，则就租用之会馆房屋，加以改筑。

三十四年，抗战胜利。三校奉命于三十五年暑假后在平、津复校，本校亦即因三校之复校而结束。本校之存在虽只九年，然北大、清华、南开为本校之前身，亦为本校之后继。三校以前之历史，亦为本校之历史。三校将来之成就，亦为本校之光荣。由斯而言，本校虽与抗战相终始，而实将与国同休，永垂无极也。略述梗概，详在大事记。

（1946年5月）