加拿大的食品安全管理实行的是联邦、省和市三级管理的模式。

加拿大联邦一级的食品安全管理机构主要是卫生部和农业部下属的食品检验局（CFIA），食品检验局负责实施卫生部制定的食品安全及营养质量标准和相关政策，同时对相关法律、法规和质量标准的执行情况进行有效监督。省政府一级的食品安全机构主要负责管辖范围的相关食品企业的监督并对企业生产的产品质量标准进行检测。市政府一级的食品安全管理组织主要负责向辖区内的食品经营者、饭店、商店等提供公共健康标准并对标准的执行情况进行监督。

在实际的食品安全监督与管理过程中，加拿大的外交和国际贸易部、农业及农业食品部、自然资源部、渔业与大洋部、边境检验局、高等院校以及各种专门委员会都积极参与到工作中来，形成协调、合理、相互支持的监督与管理网络。除国家设置的官方机构外，加拿大还有大批的科研机构参与到食品安全危机管理过程。如安大略省的奎尔夫大学食品安全研究所就承担了安大略省农业部安排的食品安全监控样品和社会各类机构送检的样品检验任务，且作为第三方检测机构在加拿大国内享有极高的社会认知度和影响力。

在食品安全治理方面，近年加拿大做出了重要的立法举措。2012年11月22日加拿大通过了新的食品安全法。该法的核心条款在2015年正式实施。此法在监管机构建设、立法建设和食品安全合作治理方面均具有创新性，并对国际食品贸易和WTO法律机制产生新的影响。

虽然看起来加拿大的食品安全管理部门林立，但是这些庞大的管理网络机构依据《加拿大农业产品法案》和《食品与药品法案》有着明确的职责分工，联邦政府负责管理跨省贸易和国际贸易的食品；省政府负责管理省内贸易的食品，包括零售业、食品服务业和食品加工业等。

CFIA的职责主要有三项：即提高食品安全（提高食品安全水平，促进公平的标签制度）、保证动物健康（促进动物卫生，防止动物疾病传染给人类）、保护植物资源（保护植物资源，保护植物和森林免遭病虫害的侵袭）。其中提高食品安全水平、保护消费者的健康是其最重要的职责。CFIA的最终目标是食品安全能够完全满足所有联邦法规的要求。CFIA的检验范围为：食品安全：鱼类、乳制品、蛋类、肉类卫生、蜂蜜、新鲜水果和蔬菜、加工产品、零售产品、消费者食品。动物卫生：兽医生物制品、动物的运输、饲料。植物保护：植物保护、种子、肥料。(www.daowen.com)

CFIA的日常工作涉及对各类食品进行检验；促进和推广HACCP在发生食品安全紧急情况和事故时，及时地作出反应；与其他国家政府合作，制定共同认可的食品安全操作方法和程序；规范食品标签；对不符合联邦法规要求的产品、设施、操作方法采取相应处罚措施等。CFIA在食品生产流程中的监管职能为：投入阶段的业务活动包括注册、标签管理和食品成分核查、取样、调查和实验室分析。生产阶段的业务活动包括监察、调查、应急措施（检疫、消除、分区管理）和产品注册。加工阶段的业务活动包括检验设施和程序、审查和认可HACCP计划并核查执行情况，对违规现象进行处理，取样和标签核查。分销和运输阶段的业务包括检查、监察运输工具的结构、卫生状况、温度和湿度，检查、监察粮库和饲料厂卫生状况。消费者、零售、食品服务阶段的业务活动包括与其他公共卫生机构进行合作，对投诉或问题进行调查，对产品实施回收并向公众通报险情，对零售产品的成分、标签、质量和容量进行检验。

CFIA在促进和推广使用有效的操作规范方面发挥了突出的作用，主要促进和推广的规范有：HACCP措施，鼓励企业建立并运行，同时提供HACCP系统认证，并对执行状况进行核实，使所有的食品法规都在HACCP系统下得以实施；质量管理计划（QMP），该计划是一个基于HACCP原理的规划，该规划自1992年起在加拿大的鱼产品加工部门强制执行；食品安全督促计划（FSEP），该计划是一个为农业食品部门制定的规划，该规划在肉类和家禽加工厂实行得比较普遍，在乳制品、蜂蜜、鸡蛋、蔬菜水果加工业内也广泛应用。在家禽领域有8家企业（约占13%）实施了现代化家禽检验规划。CFIA还对《肉类检验法》起草了一个修正案，以便为该规划的强制实施提供必要的法律基础。

CFIA还承担加拿大农业部的“加拿大食品安全调整规划（CFSAP）”的管理工作，并对该规划的实施提供科技支持。CFSAP是由CFIA和农业部及食品行业的有关人员共同设计的，它对CFIA正在实施的FSEP和QMP具有很好的补充作用。CFIA还向另外一个由加拿大农业联合会管理的规划“加拿大农场生产食品安全规划（COFFSP）”提供科学和技术方面的支持，它通过联邦政府和产业界的合作，鼓励生产者在农场的食品生产环节实施与HACCP原理相一致的食品安全措施。CFIA对CFSAP和COFFSP计划的参与体现了其改进食品安全的承诺，即从初级产品生产到最终产品零售的多部门、跨行业的食品安全协作，最终实现从农场到餐桌的食品安全管理。

在加拿大联邦一级的食品安全管理机构中，CFIA是最主要的机构。CFIA总部设在渥太华，有4个执行区，即大西洋区、魁北克区、安大略区和西部区。各区设立区域办公室，下设18个地区办公室，185个现场办公室（包括入境边检站），408个设在企业的办公室和22个实验室及研究机构，共有4600人，分级设立国家FSEP（食品安全督促计划）/HACCP协调员、四地区FSEP/HACCP协调员、FSEP/HACCP专员和责任监督员。CFIA负责如下法律的管理和执行：《加拿大食品检验署法》、《加拿大农业产品法》、《农业和农产食品行政货币处罚法》、《消费品包装和标识法》有关食品的部分、《饲料法》、《化肥法》、《水产品检验法》、《食品和药品法》有关食品的部分、《动物卫生法》、《肉品检验法》、《植物保护法》、《植物育种者产权法》、《种子法》。CFIA执法方法包括：检验、检查和其他核查措施；申报；检测、实验室分析和文件审查。

CFIA是加拿大负责公共安全和边界安全管理机构的组成部分之一。加拿大边境服务署（Canada Border Service Agency，CBSA）对所有进境的人和物进行管理，针对进口食品，CBSA和CFIA分工协作管理。食品进口时，CBSA按照分工，可以进行抽样、核放，属于需要CFIA审核检验的，则将相关信息发至CFIA，获CFIA反馈指令后放行。对不同国家进口的食品，采取不同级别的管理模式，一般前五批必检。针对出口食品，要求任何出口产品一定要符合进口国法律、法规，手续齐全即放。如果加拿大与其他国家间有相互的食品检验认证协议，CFIA还向出口食品颁发证书，以证明这些食品达到了这些进口国的有关要求。