在手中权力日渐增大，政治地位初步稳定之后，唐宣宗便开始着手处理为害唐朝多年的宦官问题。唐宣宗之所以如此迫切地想解决宦官问题，根本目的是恢复唐朝的清明政治，直接目的却是为自己的父亲唐宪宗报仇。

为了解决宦官问题，他召宰相令狐绹前来商议。令狐绹对唐宣宗说：“要想清除宦官势力不可操之过急。有罪必究，有缺必补。等他们自己消耗殆尽就可以了。”然而令狐绹的建议还未被采纳，就很快传到了宦官的耳朵里。因为这件事，朝臣和宦官之间的矛盾又进一步加深了。

当时有个叫李敬宴的宦官为人十分嚣张，遇到宰相郑朗居然不回避也不下马。唐宣宗得知此事后大怒，马上召李敬宴前来问话。宣宗问他：“你奉命出使，自可通行无阻。但怎么能因私外出，遇宰相而不回避？”没想到李敬宴却禀报宣宗道：“供奉官照例不必回避。”唐宣宗听他如此说，马上下旨收回李敬宴的一切职权，发配到南衙去当贱役。

唐朝有宦官监军的传统，为了防止这些宦官在地方上扰乱军政，作威作福，唐宣宗重新制定了相关规定。在新的法规中，一旦地方的节度使出现了什么差错，那么该地的监军使与节度使一起领罪，这样也就实现了当时设立监军使的初衷。唐宣宗的一系列举措虽然没能彻底地解决宦官问题，但也确实大大打压了宦官们的嚣张气焰，颇受朝臣和天下百姓的赞扬。

唐宣宗开始着手处理当年宪宗被谋害一事，将当年涉及宪宗谋害事件的大批宦官和外戚处死或者流放。这次的清洗活动前前后后共进行了六年，直到大中八年（854）年初才告一段落。(www.daowen.com)

对于发生在文宗时期的“甘露之变”，唐宣宗心里也有着无限的感慨。他虽然为自己的哥哥文宗所惋惜，但又颇看不起李训和郑注两人，所以他在后来为“甘露之变”中被枉杀的官员平反的过程中独独落下了李训和郑注。

一日朝会之上，宣宗看宰相马植腰间扎了一条十分贵重的腰带，便问他从何而来。马植不敢隐瞒，就对宣宗禀报说是左神策军护军中尉马元贽所赠。马元贽在拥立宣宗的时候立有大功，而这条腰带就是唐宣宗当年为了嘉奖他特意赏赐给他的。因为马元贽在宣宗朝极受皇帝的恩宠，所以大臣们都争相与之交好，而宰相马植就是其中之一。因为他们二人同姓，马植就与马元贽攀为本家，往来十分密切。为了表示自己的情谊，所以马元贽便将唐宣宗当年所赐的这条腰带转赠给了马植，没想到却被宣宗一眼认出。

第二天，唐宣宗就下旨将马植贬为天平军节度使，后又贬为常州刺史，他的从属们也都受到牵连。这对抑制宦官与朝臣勾结，擅权夺政也产生了一定的效果。