从海丰到桂林，黄旭华一路目睹同胞遭遇敌机轰炸的惨状，眼见祖国大地的满目疮痍，他毅然放弃了学医继承父业的念头，决心学习航空或造船技术，走科技报国之路。不久，他以优异的成绩考进上海交大造船系。“在交大，我参加了党的外围组织山茶社，后成为该社负责人，积极从事抗日救亡的学生运动和文艺宣传活动，同时秘密读了许多进步书籍，思想豁然开朗。后在地下党组织的教育引导下我加入了中国共产党，从此以后，自己的前途和国家的命运就紧密地联系在一起了”，黄院士回忆说。

新中国成立不久，帝国主义与反动派相互勾结，企图把新中国扼杀在摇篮之中。为了巩固新生政权，保卫世界和平，防止核讹诈，1958年，聂荣臻元帅向中央打报告请求发展核潜艇。报告很快批下来，核潜艇的研制工作马上进入准备状态。1959年，赫鲁晓夫访华，中国提出希望苏联帮助发展核潜艇。赫鲁晓夫的态度非常傲慢，他说，“核潜艇在技术上非常难，花钱又非常多，你们中国搞不出来，只要我们苏联有了，大家建立联合舰队就可以了”。毛主席听后，说了至今仍为核潜艇战线职工们所津津乐道的一句话，“核潜艇，一万年也要搞出来”。为此，中国走上了独立自主研制核潜艇的征途，同时也决定了黄旭华的人生走向—隐姓埋名研制核潜艇。(www.daowen.com)

据黄旭华院士介绍，当时，上级选中他来搞，是看他有船舶制造专业的学历和几年仿制苏式常规潜艇的经历，“说实话，我知道的核潜艇，就像古希腊人谈宇宙一样混沌一片，只知道核潜艇是以核能为动力的潜艇，其他一无所知”。“组织上调你做这种默默无闻而又风险极大的工作，你不会有思想波动吧”，记者插问。黄院士听后笑着回答说：“那时领导对我说了三点，一是党和国家信任你，二是这个工作领域进去了就出不来，三是一辈子出不了名，当无名英雄。我听后欣然答应了。那时确是没有名利思想，只想尽快投入到研制工作中去。”从那时起，黄旭华就没有回过老家，也很少与家里通信，亲属和朋友都以为他消失了。