曾有人提出教育教学应该是择高而立、向宽而行、往深而思。培养医学生的自主学习能力和责任感，符合医学院提出的培养有灵魂的卓越创新医学人才的要求。

教学不是独奏，而是协奏、合奏。让学生参与，主动思考，提升能力，课堂效果才能体现出来。这需要教学内容、方法及手段的不断变化、更新。

教育是一门科学，也是一门艺术。如何把枯燥的理论讲得生动有趣，激发学生的学习兴趣是蔡军一直在思考的问题。每节课前他都要认真备课，寻找大量案例与理论结合。同学们一致评价蔡老师的课深入浅出，生动有趣。蔡军还非常重视课程思政，将思政融于课程教学中，在病理和法医学教学中融入大量思政素材，由此编写的全新教材曾获得过医学院课程思政设计竞赛的十佳思政素材。比如介绍冠心病内容他首先会引入一些真实的事件，诸如经常看到的医护人员在路上或景区紧急救治那些心跳骤停的病人，告诉学生那种职业责任感。他每年参与各教学团队PBL教学，撰写PBL案例，并多次获得全国及医学院PBL案例大赛奖项，这些PBL案例也极大提高了医学生的自我学习、思考能力和人文、职业精神。他开设选修课“诊断病理学”，将基础与临床病理紧密融合，提高医学生在基础学习阶段对疾病的认识。他带教指导多届RBL学生科研工作并撰写和发表论文，指导医学生接触科研文献，训练他们理解、分析及论文撰写等科研基本功。(www.daowen.com)

病理尸检及形态观察也是一项重要的教学工作，也是病理学及法医学的教学特色之一。蔡军每年都组织学生到现场观看病理尸检，并进行现场教学，病理知识结合医学人文，使学生得益匪浅。由于尸检条件受限，如尸源、场地等因素，不利于大量学生现场观看，蔡军近年来组织开发病理解剖虚拟仿真实验教学系统，结合现在流行的技术，逐步设计、开发诸如基于虚拟现实技术在病理尸检案例教学系统，通过虚拟现实技术将尸检案例显现出来，让学生在虚拟但又接近真实的场景中自己进行尸检模拟操作、形态观察及分析讨论，并得出结论。同时他也及时将这些制作的设想、内容和学习情况撰写成教学论文发表，供同行交流学习。这些新颖而前沿的教学手段，拓宽了教学内容，提高了学生参与度。