蔡军从自身做起，潜心钻研学术，提高教学能力。她更坚持教书与育人相统一、言传与身教相统一、潜心问道与关注社会相统一、学术自由与学术规范相统一。她连续6次获得上海交通大学年度教工考核优秀，4次荣获上海交通大学优秀教师奖、2016年获得上海交通大学优秀教师特等奖。此外，还曾当选为上海市徐汇区第十四次人民代表大会代表、上海市第十四次妇女代表大会代表、上海市徐汇区少数民族联合会副会长、上海市徐汇区华侨民族宗教事务工作委员会委员等社会兼职，获得上海市民族宗教系统世博工作先进个人称号。蔡军不仅注重传授知识，更注重学生的素质培养及能力提升。2005年指导本科生在第四届全国建筑学专业大学生建筑设计作业观摩与评选中获评为优秀作业；2012年带领研究生参加釜山国际建筑设计工作坊竞赛获得二等奖及三等奖；在2015年及2017年全国大学生建筑设计方案竞赛中，指导本科生获得优秀奖3项。她还积极组织本科生的PRP项目和大学生创新创业计划，曾获得上海交通大学第七届PRP项目优秀论文奖（2005年）及上海大学生创新创业训练计划结项优秀（2018年）。正如参加蔡军指导的第十四届大学生创新计划项目组组长邱宇所说：通过参加大创，提高了自主学习能力，培养了发现问题、解决问题的能力，拓宽了视野，突破了课程局限，做研究是对自己综合能力的提升。

蔡军是我校建筑学科第一位招收博士生的博导，实现了我校建筑学专业博士生“零”的突破。她坚持以德立身、以德立学、以德施教，在教书育人过程中更注重学生品格的培养。她亲自指导的研究生2人次获得国家奖学金，其中一位还获得了新西兰惠灵顿维多利亚大学博士全额奖学金，并圆满获得博士学位。2人次获得上海市普通高等学校优秀毕业生称号、2人次获得上海交通大学优秀毕业生称号、上海交通大学辅导员标兵称号、上海世博会上海市志愿者称号等多项荣誉。她教授过的学生有多名已成长为著名学府的教授、博导，大型设计集团担当重任的主力设计师，扎根新疆、带领少数民族群众科学致富的年轻干部。(www.daowen.com)