在教书育人的过程中，蔡军注意兼顾对不同层次学生的引导，通过不同手段点燃学生的学习热情。不论是面对热爱本专业的学生，还是学习上有些吃力、甚至想转专业的学生；不论是本国学生，还是留学生；不论是内地学生，还是偏远地区的学生，她都一视同仁，总是寻找最恰当的方式方法因材施教，及时解决他们学习生活中遇到的问题。课堂教学之外，她总是照顾在学习上有一定困难的学生，通过微信解答课堂上留存的问题，对于优秀学生则给出一些建议和启发，使其能做更多的思考，攀登新的高峰。结合建筑学专业教学特点，蔡军在为本科生开设的“建筑设计及其理论”课程“师傅带徒弟”般融洽的教学氛围中，和学生广交朋友、倾心交谈，学生都很愿意将自己的心里话、毕业后的打算及人生理想与之倾诉。蔡军经常结合自身的实践经验、留学经历，引导学生积极向上，巧妙解决课程学习与社会活动之间的矛盾，为走向社会奠定基础。在主讲课程“中国建筑史”的教学过程中，蔡军将课程思政巧妙引入。明德启智、求真创新，在传授专业知识的同时，结合该课程讲授特点，培养学生高度文化自觉和文化自信，弘扬中华文化，提升学生的爱国热情。

蔡军指导的研究生帕如克·阿里木是土生土长的新疆孩子，她专门为他制定了一套学习方案，开展了以“结合中国传统建筑与民族特色文化”的课题研究。由于课题选择恰当，帕如克在研究生阶段研究兴趣浓郁，积极开展调研和发表学术论文，在毕业答辩过程中得到评委的一致肯定，并建议推荐为校优秀硕士论文。在课程之余，帕如克连续三年带领学生团队走访新疆企事业单位20余家，接待132家民族地区企事业单位，对民族学生一对一就业引导200余次，2017年帕如克以优异的成绩获得上海交通大学优秀毕业生称号及辅导员标兵称号。毕业后，他毅然回到新疆，到最艰苦的基层去为家乡人民服务。直到今天，蔡军还与帕如克保持着紧密的联系，分享他在工作中取得成绩后的喜悦。(www.daowen.com)