从教30余年，杨建民坚持每年为本科生授课，不仅承担了“船舶流体力学”和“船舶推进”核心专业课，还先后开设了“船舶与海洋工程导论”“海洋工程环境载荷”“船舶与海洋工程试验研究”等本科生课程，形成了海洋工程学科骨干课程体系。在本科生课程“船舶与海洋工程导论”上，不仅有扎实的水动力学知识、最前沿的科技成果，还有杨建民扎根祖国大地的爱国情、报国志。他的课成了“网红”课程，深受学生们的喜爱，评分很高。杨建民常常对学生们说：“祖国的需求始终是最深切的召唤。我们交大人，必须把自己的学业和研究与国家的战略需求联系起来，这样才能不迷失方向。有了大舞台，才能有大眼界，做大事业。”

杨建民的教学思想一贯是重视基础教学，重视试验教学，要求学生专业知识面宽，理论联系实际。我国船海专业规划教材《海洋工程水动力学试验研究》、“十二五”国家重点图书《船舶与海洋工程环境载荷》等，都是他带领团队倾注了大量的心血编著而成的。教材博采众家之长，结合交大船舶与海洋工程教学实践，自成体系。

每当学生在学习中遇到问题时，杨建民经常鼓励他们独立思考、独立解决，让他们充分打开想象空间，鼓励他们不要迷信权威，相信自己探索和创新的能力。在科研中他要求学生协同工作，组成合适的团队和研究小组，共同攻关具有一定难度的技术问题。他担任指导教师的“深海矿产资源开发装备研发”项目获2017年第十五届全国“挑战杯”特等奖，这是船建学院首次获此殊荣，也是全国船舶与海洋工程学科首次获得该项赛事近30年历史上的第一个全国特等奖。(www.daowen.com)

2019年，杨建民主持的教学成果“服务海洋强国战略，创建与新时代同向同行的船海工程一流人才培养体系”获得上海交通大学教学成果特等奖。