本书从两个方面考虑模型的设计：一方面，从系统的环境、目标和个体分析参与系统的主体在系统中的作用，在动态的环境中分析抽象的系统模型，修正系统的灵活性、稳定性等性能；另一方面，模型尽量忠实于真实的社会系统所面临的情境，具有能够反映主体真实属性的参数，同时兼顾真实系统的真实性和抽象模型的概念属性。

本书建立了一个简化的包含三个创新主体（企业、大学和科研院所）的系统模型。每个创新主体用计算机语言表述为一个智能主体（Agent），包含一系列的属性和状态（即对象的属性变量），这些属性变量大体分为两类：第一类是环境变量，用于反映主体所处的环境；第二类是模型属性变量，用于表征模型主体的属性。模型属性变量具体分为三种：第一种为内部变量，表征主体内部的属性；第二种为输出变量，作为输出信息会影响其他主体的变量；第三种是输入变量，直接受其他主体属性（其他主体的输出变量）或环境变量影响的变量，即其数学关系中包含其他主体的属性或环境变量，体现主体如何受其他主体或环境的影响。每个主体的属性都表征其当前的状态值，同时其历史值存于一定的数据结构之中，以作为计算当前某些属性值的依据。主体的属性可以是常量或变量，如果是变量，会依赖于本主体的其他属性（当前值或历史值）、其他主体的属性（当前值或历史值）或自身的历史值。所有主体基于一定的属性初值开始迭代计算，最终可以计算出一段历史时期内每个主体各个时间点的所有属性值，形式如表4-1所示。

表4-1　多主体系统状态演化表

对于每一个主体（企业、大学和科研院所），假设其某一方面的特性或水平（即属性值）可以用正实数来表示，这种属性值只表示相对水平的高低（只具有相对意义），没有绝对物理意义，因而可以任意设定其初始取值区间。不失一般性，不妨设其初始取值区间为[0，1]，0表示最低水平，1表示最高水平，那么0.5就表示普通中间水平。基于这一考虑，对于属性值的初值，如果认为其应该是普通中间水平，就应该设为0.5；如果认为水平较低，就应该设为小于0.5；如果认为水平较高，就应该设为大于0.5。只要建模时对属性变量之间影响关系的设计也与这一思路保持一致，就可以确保模型整体的相容性。

对于每一个主体，建模时关注其制度、历史积累、投入、产出四个方面的属性。

（1）制度：是一类创新主体的根本属性，决定了其投入产出效率及创新原动力等关键要素；

（2）历史积累：这类属性主要包括声誉、文化等需要长时间积累才能形成的特性，其依赖该创新主体在一个历史区间上的属性时间序列；

（3）投入：指创新主体在其制度和历史积累特性基础上，对科研工作的投入情况；

（4）产出：指在制度、历史积累、投入的基础上，科研成果的产出特性。(www.daowen.com)

这四类属性中的每一个属性都有其属性名称（直观表达其含义）、属性类型、属性符号、影响因素（哪些其他的属性会影响该属性）及数学关系，以完整定义其属性含义及属性间的相互关系。实体、属性及属性间的相互关系构成了模型的主体。

模型中体现协同创新环境，抽取影响创新环境的五个主要因素和变量：

市场化程度：env.Marketize

市场竞争程度：env.MarkComp

市场需求水平：env.MarkDemd

国家科研投入：env.StateRescFund

国家教育投入：env.StateEducFund