为了从系统层面分析企业、高等学校和科研院所在国家科技创新系统中的关系，本书利用中国R&D创新相关统计数据为分析基础。以2011年中国R&D经费的执行数据为例，可以看出国家科技创新系统中创新主体从事科技创新的总体情况。

表3-2　2011年中国R&D经费，执行、投入按部门

续表

资料来源：《中国科技统计年鉴》. 北京：中国统计出版社，2012：11.

从表3-2中国R&D投入和执行两个层面的分析可以看出：企业是R&D的最大投入者（投入经费比为73.9%），同时，企业也是R&D最大的执行者（执行经费比为75.7%），企业向大学提供了242.9亿元的经费（约占企业总投入经费比3.8%，占大学经费来源比35.3%），向研究和开发机构投入了39.9亿元（约占企业总投入经费比0.6%，占研究和开发机构经费来源比3.1%）。

为了进一步分析创新主体在R&D中的作用，本书引入研究性质的概念。目前，世界上较为通行地基于创新的线性关系将R&D的研究性质分为三类：基础研究、应用研究和实验发展。“基础研究是一种实验性或力量型的工作，主要是为了获得关于现象和可观察事实的基本原理的新知识，不以任何特定的应用或使用期为目的；应用研究也是为了获取新知识而进行的创新性研究，但它主要针对某一特定的实际目的或目标；实验发展是利用从科学研究和实际经验中获得的知识，为生产新的材料、产品和设备，建立新的工艺、系统和服务，或对已产生和已建立的上述各项进行实质性改进，而进行的系统性工作。”不同的科研组织承担不同性质的科学研究工作。

表3-3　按执行部门分组的研究与试验发展（R&D）经费内部支出（2011年）　（单位：亿元）

资料来源：《中国科技统计年鉴》. 北京：中国统计出版社，2012：6.

通过表3-3可以看出，在基础研究方面，中国大学承担了55%的基础研究，但中国大学承担的R&D经费在全国只占7.9%左右。中国的科研院所（即研究与开发机构）承担了38.9%的基础研究，中国企业仅承担了基础研究的1.8%。在应用研究方面，中国大学承担了36.2%，科研院所承担了40.6%，企业承担了18.6%。在实验开发方面，中国大学承担了1.2%，科研院所承担了10.1%，企业承担了88.1%。

由此，企业、大学和科研院所在国家科技创新中的关系得以明晰：

1.企业、政府是科研投入的主要投资者，其中企业是最大的投资者，为科技创新提供资金和市场需求。

2.企业是科研创新的主力，大学是重要的创新力量，科研院所是实现公共利益的创新力量。大学和科研院所相互配合，共同支持企业的创新活动。(www.daowen.com)

通过对研究性质的分析，企业、大学和科研院所在科研创新中的组织能力得以确立：

1.企业R&D能力：实验发展＞应用研究＞基础研究；大学R&D能力：基础研究＞应用研究＞实验发展；科研院所R&D能力：应用研究＞基础研究＞实验发展。

2.从基础研究占比看，大学＞科研院所＞企业，大学向企业和科研院所提供基础研究的理论支持。

3.从实验发展占比看，企业＞科研院所＞大学，企业的市场化水平最高，受市场影响最大。

基于以上分析，创新系统中主体和主体之间的关系可用表3-4表述：

表3-4　基于现实创新系统的创新主体及其关系分析