高等教育分流结构包括高等教育内部分流和外部分流的结构。高等教育的主要目的是培养人才，为社会和国家的发展服务。社会和国家发展需要不同层次、不同类型的人才。为了经济发展，需要经济管理人才和技术人才；为了统治者统治的需要，需要政治家；为了国计民生，需要服务人才等。根据这些目的，高等教育有了任务的分流，从而有了不同层次、不同类型、不同性质和不同地域的高等教育机构。这些机构培养不同的人才，以满足社会发展的需要。如中世纪早期，宗教在西欧社会一统天下，需要大量的神职人员以维护和巩固其统治地位，而教会学校为了满足这一需求，培养了大批神职人员。除了教会学校，封建地主阶级也需要教育其子弟以继承其统治，于是除了教会学校，宫廷教育和骑士教育也发挥了重大作用。中世纪大学产生以后，大学占据了高等教育的主导地位。高等教育分流不仅仅是高等教育机构之间不同类型、不同层次、不同性质和不同地域的分流，还应实现高等教育内部结构层次的分流。中世纪大学的内部层次已经形成，出现了学位制，法国大学的神、医、法、文四部有着明确的分层。对于现代高等教育分流而言，为了使分流更加科学、更加合理，可以实行先入学、后分流的内部分流形式，即让学生先学习一年或两年的基础学科，在打下夯实的基础，找准自己的特长和兴趣之后再进行科学、合理的分流。

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