八旗制是清代兵民合一的社会组织制度，由太祖努尔哈赤在女真人牛录制度上建成的，明万历二十九年（1601年）始建四旗，即正黄旗、正蓝旗、正白旗、正红旗。明万历四十三年（1615年）增设四旗，称镶黄旗、镶蓝旗、镶红旗、镶白旗，定三百人为一牛录，五牛录为一甲喇，五甲喇为一固山（固山即旗），满旗人按八旗制分录各旗，平时生产，战时从征。初建时，不但在军事上发挥了重要作用，而且具有行政和生产职能。大清统一，太宗皇太极又建立了汉军八旗和蒙古八旗。各旗有军营、前锋营、骁骑营、健锐营和步军营等常规队伍，司禁卫、云梯和布阵等职。

清朝统一全国后，将蒙古地区划分为多个“旗”，每旗有固定的游牧区域，为一行政单位，册封旗王——札萨克负责管理。为加强对旗务的管理，又实行“全盟”制度，即相邻的几个旗推选出一位盟主，各旗定期举行会盟，协调处理相关事物，朝廷可派员参加来加强管理。现在，内蒙古地区“旗”“盟”的称谓还在沿用。“旗”相当于内地的县，“盟”相当于内地辖县的市或地区。

1697年（康熙三十六年），清朝将和硕特部按内蒙古49旗之例，编为阿拉善和硕特旗，赐印授札萨克，封和罗理为多罗贝勒，直属清朝理藩院，阿拉善和硕特系阿拉善与和硕特二词组合而成，前者为地域之名，后者为部落之名。民国时期，曾一度属宁夏省管辖，后直隶于中央行政院，并受蒙藏委员会指挥，阿拉善和硕特旗札萨克亲王世袭共历九代十王。(www.daowen.com)

1949年9月23日，阿拉善和硕特旗和平解放，成立了“阿拉善霍硕特旗人民政府”。1950年划归宁夏省管辖。1951年将阿拉善霍硕特旗人民政府改名为“阿拉善自治区人民政府”（1951年8月18日中央人民政府内务部确定）。1954年4月正式组成了宁夏省蒙古自治区人民政府（专区级），下辖阿拉善旗、磴口县。1954年9月1日宁夏省建制撤销，合并于甘肃省，同年将宁夏省蒙古自治区暂时改称为“甘肃省蒙古自治区”，隶属甘肃省。1955年3月31日将甘肃省蒙古自治区改称为“甘肃省蒙古自治州”。同年11月21日，经国务院同意，将甘肃省蒙古自治区改名为“甘肃省巴音浩特蒙族自治州”。1956年4月3日，国务院全体会议第26次会议通过，将甘肃省巴音浩特蒙族自治州和额济纳自治旗合并，成立巴彦淖尔盟（下辖阿拉善旗、额济纳旗、磴口县、巴彦浩特市），划归内蒙古自治区领导。同时，将巴彦浩特镇改设为巴彦浩特市。1958年7月19日，巴彦淖尔盟由巴彦浩特迁至巴彦高勒（三盛公）。1961年4月将原阿拉善旗分设为阿拉善左旗和阿拉善右旗，隶属巴彦淖尔盟。1969年阿拉善左旗划归宁夏回族自治区管辖，阿拉善右旗划归甘肃省武威地区管辖。1979年阿拉善左旗和阿拉善右旗又划归内蒙古自治区阿拉善盟，辖阿拉善左旗、阿拉善右旗、额济纳旗。1980年5月1日，阿拉善盟成立，盟机关驻巴彦浩特。