（1）医治战争的创伤（物质的重建）。南部的问题是紧迫和复杂的，南部同盟的11个州由于战争而完全陷于贫困状态，它们战前的经济实际上已遭破坏，财产破坏也是巨大的，城市被焚毁，铁路被拔掉，桥梁被破坏，整个南部的土地荒芜了，种植园也破败不堪，南部同盟的债券和货币现在一钱不值，投资与债券于货币的资本完全付诸东流。随着奴隶的解放，南部白人（奴隶主）被剥夺的财产，估计约为20亿美元。

战争结束后的几个月，南部成千上万的士兵和伤员不得不返回家乡，但生活极其艰难困苦，300多万被解放的黑奴更是衣食无着，穷困交加。

从今天的眼光来看，物质重建的责任当然落在联邦政府的肩上，但在1865年自由放任哲学盛行之时，一般认为这种责任应完全由个别州和私人企业负担，也就是南部应自行恢复、医治创伤。

（2）政治重建问题：原南部同盟各州的政治地位成了问题。

对南部各州如何处理和改造的问题，资产阶级和共和党各派的看法是不同的。①共和党的保守派认为南部州发动和参加了叛乱，但他们并未脱离联邦。只要南部各州结束叛乱，废除奴隶制度，服从宪法并承认联邦的统一，便可立即恢复它们在联邦中的平等地位和正常关系。②共和党激进派则认为南部各州由于发动叛乱而自绝于联邦，丧失了“州”的地位，因而主张把他们作为被征服的省份加以管制，甚至把它们作为殖民地长期进行统治。国会将委派总督、制定法律。把它们当作其领地，进行治理，并且有权决定每个“领地”何时才能成为州，重返联邦。(www.daowen.com)

（3）对南部叛乱领袖的惩处问题。怎样处理杰斐逊·戴维、亚历山大·斯蒂芬斯、罗伯特·李以及其他同盟领袖的问题使北部感到困惑。宪法规定对叛国者应处死刑，因而有些人认为应按此规定执行。有些北部人则主张对南部叛乱领袖实行终身监禁，也有些人认为可以释放他们，但今后不得参加政治生活，另一些人认为他们应该被赦免。

（4）解放奴隶的问题，内战的结果，南部300万奴隶获得了解放，北部面临如何安置这些黑人的问题。大多数原先的奴隶都是非技术的农业劳动者和文盲。国会是否任由这些人被南部人虐待，还是教育和训练他们成为公民，还不大清楚，第十三条修正案宣布奴隶制为非法，它在1865年12月获得批准，但国会尚未决定采取措施来保证黑人享有与白人同等的政治、社会权利。

其他还有军事复原和经济复原以及工业发展等问题。