1999年，广西供销合作社系统创建农产品行业协会71个。农产品行业协会是依托基层供销合作社的农产品生产基地，联结农户和购销大户，开展农社联营。其会员以基层供销合作社企业为主，数量较少。

2000年后，随着供销合作社参与和推进农业产业化经营的深入，广西各级供销合作社实行“开放办社”，联合社会力量，牵头组建一批农产品行业协会。2002年8月，桂林市供销合作社组建桂林市农产品流通发展协会，由百色地区供销合作社牵头组建的百色地区桐油协会第一次代表大会召开暨百色地区桐油协会成立。10月，百色地区桐油协会第二次代表大会召开，通过《广西百色地区桐油协会章程》，明确协会是以本地区供销合作社系统桐油经营企业及其主管部门为主，吸收国营、集体、个体桐油生产、流通企业及地区有关经济管理部门参加的全地区范围内的社会团体。业务主管部门是广西百色地区供销合作社。该会名誉会长由百色市政府分管供销合作社工作的副市长担任，会长由市供销合作社主任担任。

2003年，容县供销合作联社牵头组建容县粮食良种推广协会，入会农户1803户，联合农户10843户，组织全县60%的农户种植良种水稻达1.1万亩，推广优质水稻良种1.7万公斤，帮助农民增加收入120万元。2004年8月，武鸣县供销合作联社牵头组建武鸣县蔬菜协会。在13个乡镇和部分大的行政村成立分会，吸收9345名农民加入协会，引领41560户参与农业产业化经营，发展“订单农业”，创办9个优质农产品示范基地，帮助农民实现人均增收1000元以上。年底，广西各级供销合作社有农产品行业协会55个，会员5万多人，全年经营总额1.57亿元，带动农户4万多户。

2005年，全系统组建各类行业协会63个，其中80%以上为农产品行业协会，会员6297人。63个行业协会中，自治区级1个、地（市）级18个、县级及以下44个。

2006年9月，自治区政府授权自治区供销合作联社为相关行业或业务范围内的社会团体的业务主管单位，对全系统行业协会规划提出指导性意见。各地供销合作社依托自身的经营资源，整合流通网络，联合农业产业化经营龙头企业、生产基地、专业大户等，组建一批农产品行业协会。10月，经玉林市政府审批，玉林蔬菜协会由玉州区供销合作联社和玉林市蔬菜副食品公司发起成立，发动当地蔬菜种植营销经营大户150多人入会，联结和带动5000多户农户种植绿色蔬菜，培育“放心菜”，被自治区商务厅指定为城乡市场信息服务系统样本单位，当选为中国蔬菜流通协会的理事会成员单位。同年，资源县东田供销社会同当地有关部门、蔬菜生产农户和经营大户组建东田乡无公害协会，有会员158人，会长为东田供销合作社主任，名誉会长由乡政协主席担任，其他副会长分别由农技站站长、蔬菜生产经营大户代表等担任。该协会引进以色列189、荷兰白利、澳洲番茄等国内外优良高产品种，在当地落户种植，被自治区民政厅授予“广西农村专业经济协会示范点”牌匾。当年，广西供销合作社系统共组建各类农产品协会35个，联结带动农户13万多户。(www.daowen.com)

2009年，全自治区各类农产品行业协会增加到225个，会员5.4万户，联结带动农户13万户。

2010年，全自治区各级供销合作社围绕水果、蔬菜、蚕茧、优质粮油等主导产业，联结农民专业合作组织和社会能人组建行业协会，整合社会资源，促进农民增产增收。

到2011年，广西供销合作社系统领办各类行业协会263个，会员单位增至58万户，全年经营总额4亿多元，带动农户15万多户。