1998年后，广西供销合作社系统建立为农服务组织机构和专业队伍，注重抓好农副产品龙头企业的培育并发挥其带动作用。2000年10月，实施市场带动战略，把茶叶、桐油、果菜、桑蚕茧、木薯淀粉、畜牧养殖、饲料加工、冷藏加工等与农业产业化相关的企业作为龙头企业来培育和发展。通过龙头企业外联市场、内联基地，逐步形成“市场牵龙头、龙头带基地、基地联农户”的农业产业化经营模式。2001年，象州县供销合作社联合社以茧丝公司为龙头，建立桑蚕茧基地543公顷，与农民签订桑茧购销合同3700多份，辐射带动农户8365户。举办种桑养蚕技术培训125期，受培训农户7800人次，印发技术资料2万份。全县桑园面积由上年的309公顷发展到2010公顷，全年生产鲜茧50万公斤，产值2700万元，全县养蚕户占全县农户数的62%，种桑养蚕成为当地农民脱贫致富的一项重要支柱产业。象州县供销合作社联合社也在扶持农民发展商品生产中实现自我发展，县茧丝公司当年收购桑蚕茧1359吨，收购额1783万元，分别比上年增长146.25%和95.29%。

2002年，全自治区供销合作社系统发展了一批与农业密切相关的商贸、加工、种养、服务等各种类型的龙头企业。年底，全系统被认定为自治区级龙头企业4个：南宁市桂果香果品有限公司、田阳农副产品综合批发市场、广西石乳茶业有限公司、柳州地区土产公司。其中，田阳县农副产品综合批发市场为第一家被确定为自治区级重点龙头企业。当年，田阳县农副产品综合批发市场交易额7.3亿元，市场交易量47万吨。

被认定为第一批全自治区供销合作社系统农业产业化经营重点龙头企业17家：南宁市果品食杂公司、广西石乳茶业有限公司、广西横县茶厂、广西贵港市农业生产资料公司、广西柳州地区土产公司、广西象州县茧丝有限公司、广西桂林全州县冷藏开发总公司、玉林市粤桂食品厂、兴业县山心供销合作社、广西田阳农副产品综合批发市场、广西田林县八渡笋有限责任公司、广西那坡县大鸿八角有限责任公司、广西灵山县供销合作社联社农牧发展有限公司、浦北县供销合作社联合社扶贫开发有限责任公司、河池市供销合作社总公司水果批发市场、钟山县供销合作社联合社宏发食品厂、广西南宁南园大厦饭店。这17家企业带动农户21万多户，帮助农民实现收入8亿多元。

2005年，广西供销合作社系统通过凝聚优势、整合资源，培育发展有较强社会影响力、产业带动力、市场竞争力的区域性龙头企业，创办33家自治区供销合作社系统认定的农业产业化龙头企业、4家自治区级龙头企业。其中农副产品加工企业15家、农副产品经营企业9家。联结带动农户33万户，比上年增长51.12%；帮助农民实现收入21.6亿元，比上年增长59.12%。

2007年，广西供销合作社系统依托龙头企业组织产业化经营，以广西富满地农资股份有限公司为龙头，建立农资连锁配送经营体系，组建大型连锁配送企业，推进富满地农资连锁经营和为农服务网络建设，建设农资连锁店600家；以广西石乳茶业有限公司为龙头发展有机茶产业，以梧州茶厂为龙头做强六堡茶品牌。年内，梧州茶厂六堡茶不仅产销量实现增长，还获得第四届中国上海国际茶业博览会金奖、中国郑州国际茶业博览会茶叶质量评比大赛黑茶茶王称号和广西第三届名优茶（黑茶类）擂台赛擂主称号。

2008年后，在重点龙头企业的带动作用下，全自治区供销合作社系统连锁配送企业发展到33家，配送中心增至47家，连锁经营网点增至6725个，连锁配送企业全年实现销售额14亿元。

当年，被评定为第二批全自治区供销合作社系统农业产业化经营重点龙头企业13家：玉林市蔬菜副食品公司制冰厂、博白县土产公司和记（博白）工艺品厂、宾阳县土产公司、梧州华友商贸有限公司、玉林金城商厦有限责任公司、玉林市物资回收公司、金秀瑶族自治县桐木供销合作社、岑溪市水汶供销合作社、岑溪市三堡供销合作社、天峨县供销合作社联合社高楼山多种经营场、东兰县供销合作社联合社综合养殖场、蒙山县供销合作社联合社瘦肉型良种猪养殖场、武鸣县农资公司农资专业市场。(www.daowen.com)

2009年，广西供销合作社系统从深化社属企业改革入手，采取多元化投资的方式，整合资源，培育发展辐射带动能力强的重点龙头企业，使其成为供销系统提升参与农业产业化经营层次和水平的重要载体。各级供销合作社强化龙头企业与基地农民利益联结机制，以龙头企业、合作经济组织为依托，大力推广“公司+基地”“品牌+公司+合作社+农户”的经营模式，实现双赢。

至2010年，广西供销合作社系统增建第三批、第四批全自治区供销合作社系统农业产业化经营重点龙头企业，自治区供销合作社级重点龙头企业总数达到46家。

第三批全自治区供销合作社系统农业产业化经营重点龙头企业8家：忻城县瑞龙丝业有限责任公司、北流市丰盛罐头食品厂、合浦县石康供销合作社利康花生油厂、广西万佳粮油厂、广西富满地农资股份有限公司、防城港市边城贸易总公司、防城港市供销合作社联合社华石猪场、柳江县山水农场。

第四批全自治区供销合作社系统农业产业化经营重点龙头企业14家：平果县穗丰农资配送中心、桂林康乐人粉业有限公司、龙胜各族自治县千乡工业品连锁经营有限责任公司、龙胜各族自治县果丰农业生产资料有限责任公司、永福县供销社万通农资配送有限公司、平乐县绿鑫农资连锁有限公司、桂林市临桂万和连锁超市有限公司、桂林市临桂万丰农资连锁有限公司、全州县农业生产资料公司、柳州市满地宝农产品开发有限公司、广西富满地农资连锁配送有限公司、横县桂隆畜牧有限责任公司、兴安县高尚秀峰白果购销合作社、贺州市八步区大铺猪场专业合作社。

2009—2010年，广西供销合作社系统有11家中华全国供销合作总社级重点龙头企业、4家自治区级重点龙头企业、46家自治区供销合作社系统级重点龙头企业，共61家重点龙头企业，联结带动农户187万户，帮助农民实现收入128亿元。

2011年，广西供销合作社系统全行业有自治区级龙头企业4家、自治区供销合作社级龙头企业37家。当年，田阳县供销合作社联合社以农副产品综合批发市场为龙头，将服务体系向重要农产品主产地延伸，建成玉凤、百育、新民、那坡等农贸市场一批，逐步形成县、乡（镇）、村三级农副产品市场交易体系。面对当地气温偏低，西红柿等冬菜上市时间推迟，致使农产品价格出现较大波动的局面，田阳县农副产品批发市场采取批发交易、代购代销、联购联销、代储代运等应对措施，促进蔬菜销售，全年实现市场果蔬交易量近70万吨，交易额17.3亿元，比上年增长33.5%。