李自成进入北京以后，一面出榜安民，一面严惩明朝的皇亲国戚、贪官污吏。他派刘宗敏和李过，勒令那些权贵交出平时从百姓身上搜刮来的财物，充当起义军的军饷，拒绝交付的统统处以死刑。这时，有人告诉李自成，吴襄的儿子吴三桂是明朝的山海关总兵，手下还有几十万大军，如果把吴三桂招降了，岂不可以解除大顺政权的一个极大威胁。

李自成觉得有道理，于是叫吴襄给他儿子吴三桂写信，劝说他向起义军投降。吴三桂收到吴襄的劝降信，处在犹豫之中，向起义军投降吧，从心底是不愿意的；不投降吧，起义军勇猛善战，兵力强大，自己不是对手。同时，北京城里还有他的家属和财产，也舍不得丢掉不管。由此，他决定带兵到北京看看情况再议。

吴三桂带兵到了滦州，离北京很近了，碰到一些从北京逃出来的人。吴三桂找来一问，听说他父亲吴襄已经被起义军抓了起来，家产被抄，心里恨得咬牙切齿，后又听说他最宠爱的爱妾陈圆圆被农民起义军首领刘宗敏所占，怒气冲天，立刻下令军队全部退回山海关，并且要将士们一律换上白盔白甲，说要为君父报仇。

李自成得知吴三桂拒绝投降，就决定亲自带领20 多万大军进攻山海关。吴三桂听到这个消息，也顾不得什么民族气节了，连忙写了求援信，派人飞马出关，请求清兵入关镇压起义军。

多尔衮采纳了他的建议，决定取道内蒙古，走喜峰口、墙子岭一带入关攻打北京，这是清军入侵中原的一贯路线。

吴三桂一边准备决战，一边继续以假谈判拖延李自成的行动，以等待多尔衮的答复。

为了让李自成确信谈判是真的，他又派出了山海关当地生员刘泰临、李友松、谭邃寰和乡绅黄镇庵、刘台山、高选6 人“轻身给贼”，这6 人在三河附近碰到了正在前来的大顺军主力，于是向李自成转达了吴三桂的谈判条件。这一计，极有效地迟滞了大顺军的行动。

此前吴三桂派去和多尔衮联络的郭云龙，已经带着多尔衮的回信和其妻弟拜然回到山海关。吴三桂于是一面再次派出郭云龙、孙文焕，带自己的第二封书信前往多尔衮处催促快速进军，一面联合当地士绅准备抵抗大顺军的军事部署。四月十一日，清军越过辽河，随即接到消息，得知李自成已攻占北京，崇祯身亡。多尔衮面对这个情况开始犹豫起来，但熟知农民军情况的洪承畴极力主张马上入关，与大顺军决战：“今宜计道里，限时日，辎重在后，精兵在前，出其不意。从蓟州、密云近京处疾行而前，贼走则即行追剿，倘仍坐据京城以拒我，则伐之更易。”

四月十九日，吴三桂开始做战前政治动员。他先在山海关演武堂（至今尚存）“合关、辽两镇诸将并绅衿誓师拒寇”，四月二十日又在校场“与诸将绅衿歃血同盟，戮力共事”，杀“奸细张有起、张五”祭旗，激励士气，准备和大顺军进行最后的决战，这就是记载中所谓的“南郊誓师”。

同日，也就是二十日，多尔衮率军到达宁远卫辖下的连山（今辽宁葫芦岛市连山县），准备扎营休息，在这里，他接到了吴三桂的第二封求援信。(www.daowen.com)

吴三桂因知道多尔衮大军改道东下，自己已经无法阻止，因此退而求其次，要求对方首先要安民，同时不理会多尔衮要他投降之事，依然坚持自己的明朝身份，清朝辅政的亲王多尔衮接到吴三桂的求援信，正中下怀，立即亲自带着十几万清兵向山海关进发。清军来到山海关下，吴三桂迫不及待地带着500 个亲兵出关迎接多尔衮，他见了多尔衮，卑躬屈膝地哀求多尔衮帮他报仇。多尔衮心中另有图谋，自然顺水推舟地答应了。

李自成大军从南面开到山海关附近，20 多万农民起义军，依山靠海，摆开浩浩荡荡的阵势，一眼望不到边。多尔衮在准备入关时，又突生猜疑之心，怕吴三桂联合农民军引诱自己入关，给自己设下一个陷阱。他与众贝勒商议后得出结论，再静观其战，窥探动静。这时天已大亮，李自成正在调动兵马，准备攻城。吴三桂更加焦急，无法再等下去，便率领10 多名将官和数百精骑一口气奔入清军营地，面见多尔衮，多尔衮的后顾之忧才彻底打消掉，并且让多尔衮欢喜的是，这次绝对是收降吴三桂的绝好时机。双方见面，开门见山，一拍即合。吴三桂随即剃发称臣，并又向多尔衮细述了当前的紧急局势。

吴三桂说道：“农民军目前还不知道清军的到来，把兵力全都集中在攻打关城的前头了，后部力量极其薄弱。我们可采取攻首尾斩其腰的战术，打他个措手不及。”

多尔衮默认点头，可在心里却又多留了一个心眼，他觉得此战非同小可，成败是一个关键。农民军既然不知我军前来，从这里便可寻出战机，先让吴三桂派兵迎战农民军，在打到一定程度的时候，自己再率重兵前往，一来可打他个措手不及，二来也算是以逸待劳，减少了自己兵力的损失。“将军对战术上的造诣让本王钦佩不已，由此可见只要我们两军联手，农民军必败无疑。”多尔衮从山海关城头望见起义军阵容齐整，料想不容易对付，于是就让吴三桂打先锋，叫清军埋伏起来，自己和几名清将远远地躲在后面的山头观战。

战斗开始了，李自成披挂整齐，骑着马登上西山指挥作战。吴三桂带兵一出城，起义军左右两翼进行合围包抄，把吴三桂的部队团团围住。明兵东窜西逃，总也冲不出重围。起义军个个英勇血战，喊杀声震天动地。正在双方激战的时候，不料海边一阵狂风，把地面上的尘沙刮起，一霎时，天昏地暗，对面看不见人。

多尔衮看准这个时机，命令埋伏的几万清兵一齐出动，向起义军发起突然袭击。起义军毫无防备，也弄不清是哪儿来了这么多敌人，心里一慌，阵势也就乱了。一时间，万马奔腾，飞箭如雨，农民军战败溃逃。混乱中，马匹自相践踏致死的人不计其数，尸体遍地，血流成河。

直到风定下来，李自成才在西山上发现清兵已经入关，想下令军队稳住阵势，指挥抵抗，可是已经来不及了，只好传令后撤。多尔衮和吴三桂的队伍乘势里外夹击，起义军遭到惨败。李自成带领将士边战边退，吴三桂和清军则在后面紧紧追赶。起义军退回到北京，兵力已大大削弱，而实力强大的清兵已成锐不可当之势。李自成回到北京的第二天，便率领起义军离开北京，向西安撤退。

多尔衮于是带领清兵顺利地进了北京城。吴三桂因打击农民起义军有功，被封为平西王。崇祯十七年（1644）十月，多尔衮以皇太极遗言“若得北京，当即迁都，以图进取”和范文程稳扎稳打的战略，把顺治帝从沈阳接到北京，把北京作为了清朝的首都，从此开始了在关内的统治。