20世纪80年代，省农垦提出实施“科技兴垦”战略。从1989年到2010年，全垦区共投入科技经费8991万元。其中国家拨款6891万元，企业自筹2100万元。

“七五”计划期间，省农垦改革科技体制，在武威黄羊镇成立了“甘肃农垦科研推广培训中心”，与设在兰州的“甘肃农垦勘测设计院”共同作为全农垦系统的科技工作机构，在为内部搞好科技服务的基础上，为社会提供有偿服务。全垦区多数农场建立了以推广农业技术为主的科研体系，为职工家庭农场提供优良品种、防治病虫害、推广农业新技术。在全垦区先后试验、示范，推广应用了上百项科技新成果，特别是地膜覆盖、化学除草、叶面喷磷、抗旱剂喷施等，在农业生产上的推广运用，对提高作物产量、病虫害防治起到了积极作用。

“八五”计划期间，省农垦农业科技、实用新技术、新药剂的推广普及程度明显扩大，农业良种化水平进一步提高，工业技术改造项目多数达产达标。先后有22个工、农业产品获省、部级奖励36次。1995年10月，在北京举办的第二届全国农业博览会上，省农垦条山、张掖、张老寺、勤锋四个农场的9种果品，获得3个金奖、5个银奖和1个铜奖。

“九五”计划期间，全垦区实施农业、工业等科技和技术推广项目245项，其中获奖50项，主要作物覆盖率达到100%，科技贡献率达到55%，重点推广种子包衣、地膜覆盖、化学除草、化肥深施、平衡施肥、秸秆还田、土壤深松、节水灌溉等已经成熟的先进实用技术，对农作物优质高产起到了积极的促进作用。

下河清农场试种2300亩炸片马铃薯，黄羊河农场稳步扩大甜糯玉米种植，为全垦区种植结构调整进行了有效的尝试。通过各种科技措施的应用，不断提高农产品的品质、质量和单产水平，逐步形成了甘肃农垦优势农产品，区域优势很快突显出来，如敦煌、小宛农场的棉花、甜瓜，酒泉玉门区域的啤酒花，河西区域大片的啤酒大麦、黑瓜子，黄羊河、条山农场及平凉农业总场的果品等。到2000年，农垦啤酒大麦芽、“西凉”和“五泉”啤酒，“莫高”葡萄酒，“好为尔”乳品，亚盛硫化碱，条山酒厂和张掖酒厂系列白酒，以及果品和水泥等产品分别在国内和省内占有了一定份额，培育出了3个“陇货精品”和5个省名牌产品企业。随着农垦名牌产品在市场覆盖面的扩大，大大提高了农垦企业知名度。(www.daowen.com)

“十五”计划期间，甘肃农垦积极推广运用新品种、新技术和先进装备，大力推进企业技术改造，不断提高企业信息化应用水平，努力完善科技创新体系，推行标准化生产，使农垦经济增长方式由主要依靠资源消耗向依靠科技进步转变，由注重外延扩张向注重内涵挖潜转变。“好为尔”公司奶牛胚胎移植技术的运用，农业研究院金盏花项目的实施，在全省实现了历史性突破。省绿色食品办公室推广和实施无公害农产品、绿色食品标准化生产技术，全垦区7个农场通过国家部、局验收，进入农业部“全国100家无公害产品示范基地农场”行列，建成“国家级绿色食品生产基地”2个，“标准化绿色食品专业生产示范基地”236万亩。

“十一五”规划期间，省农垦引进推广农作物优良品种100多个，实施农技推广和科研课题50多项，建立农业科技示范田达10万亩，农业科技产出率大幅度提升，科技贡献率达55%以上，大宗农产品优良品种覆盖率达到95%以上。有8个产品获得国家发明专利，5项科研成果获得省级科技奖项，7家农场被确定为农业部无公害农产品示范基地和国家绿色农业示范区。一批优质栽培技术、标准化生产技术、高效节水技术等在全垦区农业生产中全面推广，滴灌节水农业面积达到16万亩，建成甘肃省规模最大的现代节水农业示范区。甘肃瑞盛·亚美特高科技农业有限公司是以色列亚美特公司与甘肃亚盛股份公司共同投资兴办的灌溉设备生产厂，工厂设备世界一流，技术水平国内领先，创新发明的“引河滴灌首尾改装新技术成套设备技术”，攻克了高泥沙黄河水不能用于滴灌这一世界难题，达到了国际先进水平，获得甘肃省科技进步二等奖，在北方旱作区得到广泛应用。省农垦依托滴灌节水技术，推进水肥一体化，转变了农业生产方式和经营模式，实现了标准化生产。推广测土配方施肥技术35万亩，配方施肥面积18万亩，配方施肥技术指导入户率达95%；创建绿色食品标准化生产基地6个，恒温库贮藏能力达到2.5万吨；部分农场整体通过了ISO14000国际环境管理体系认证，制种、食品等绝大多数产品通过了质量管理体系认证。省农垦承担的农业部农垦局农产品质量追溯项目在条山、黄羊河、敦煌农场顺利实施，在条山农场建立省农垦条山农场农产品质量安全检验检测站。

省农垦创建3个国家级、9个省级农业产业化重点龙头企业，2个国家级现代农业示范区和1个国家级绿色农业示范区，20多个农产品加工龙头企业；“莫高”商标获“中国驰名商标”和“中国著名品牌”；黄羊河食品公司甜糯玉米被评为“中国著名品牌”；条山果品和蜂蜜类产品、亚兰药业商标、御米油公司“御世佳”等10多个产品商标被评为“甘肃省著名商标”。