工程建设一开始，有效监督制约机制就渗透到工程建设的方方面面，实行全过程全方位监督，使工程建设走上法制化、规范化的轨道。具体做法是：

（1）建立规章制度，完善制约机制。工程建设总指挥部制订了包括财务及合同管理、工程管理、行政管理、劳动竞赛、廉政建设等5大类45条的规章制度。通过执行这一系列的规章制度，建立起了一个结构合理、配置科学、程序严密、相互制约的运作和约束机制。

（2）派出监察审计组，实施全过程监督。省水利厅专门成立了东深供水改造工程监察审计组，负责对东深供水改造工程的监察审计。监察审计组根据所赋予的职能，围绕招投标、资金运用、工程变更、各奖项的评定等重点环节开展执法监察。在招投标工作中，从标底的编制到决标全过程实行“旁站式”监督，使招标工作顺利进行；在资金监督方面，做到经常检查账目，监督财务开支情况，防止发生账外账，转移、挤占、挪用和乱花乱支建设资金的违规现象；对工程质量和安全管理的监督，重点是检查工程质量管理和安全管理责任制的落实；对合同变更的监督重点是检查变更程序的合法性，资料的完整性、准确性，同时监督检查中标单位有否违规转包、分包工程，监督检查奖项评定过程的公开性、公平性和公正性。此外，监察审计组还对一些疑惑问题进行解释和澄清，从而保证了工程建设的顺利进行。(www.daowen.com)

（3）全面实行建设监理。一是施工监理，监理单位以“守法、诚信、公正、科学”的原则，采取旁站、巡视和平行检验等形式，认真负责地对工程质量、安全、进度和投资进行严格把关控制，有效地履行合同和信息管理及现场协调等职责；二是设计监理，在全国水利系统率先实施对工程设计进行监理，这是东深供水改造工程的一项重大突破。通过设计监理对施工图纸和重要技术的把关、审查和监督，有效提高了设计方案和图纸的质量；三是移民征地监理。征地监理按照《国土资源法》及有关政策、法规，运用计算机技术建立工程征地信息管理系统，对征地信息进行数据处理，当好中间人的角色，创造性地开展工作，提高了征地拆迁工作的公开透明度，加快了征地拆迁的进度，有效地控制了投资。