1.集流面污染

雨水集蓄利用工程集流面子系统主要包括天然集流面、已有建筑物弱透水面和专门集流面。通常情况下，这些集流面上或多或少地存在着各种可能会引起水质污染的物质，如屋面上的灰尘、鸟粪、枯叶、苔藓，庭院、场院、道路上的杂物、垃圾、畜禽粪便等。即便是在专门修建的混凝土集流面上，也会存在这样那样的污染物质。尤其是在交通公路集流面上，除前述各类污染物外，同时还存在汽车尾气、未充分燃烧的油料、沥青等污染物。因此，从这些集流面上收集的雨水必然会受到不同程度的污染，导致雨水水质较差，继而影响或者限制雨水的正常使用。

2.储存污染

通过集流面子系统收集的雨水进入蓄水设施后，正常情况下，通过沉淀、自净作用水质会得到明显改善。但如果储存、管理措施不当，则有可能会造成水质恶化。如无盖蓄水设施，会增加畜禽粪便、枯枝败叶及其他杂物落入的概率，继而为细菌及其他微生物的繁衍生长提供充足的养分；光照还会导致藻类生长，进一步加重水体的富营养化。同时，开敞式或者盖板密闭性不够的水池还将为各类蚊虫繁殖提供适宜的环境，一些水源性疾病如肠炎、腹泻、疟疾、黄热病和登革热等，都是通过蚊虫污染水源继而导致疾病的广泛传播。(www.daowen.com)

3.二次污染

目前，采用传统的吊桶取水仍然是造成取水、用水环节水体污染的主要因素。另外，家庭水缸等盛水器皿也有可能成为蚊虫滋生继而污染水体的途径。事实上，这种取水、用水环节的水污染现象目前还比较普遍。为此，绝不能忽略这种取水、用水环节和过程中形成的二次污染问题，应引起足够的重视并采取相应的措施。