调腔本《琵琶记》虽来源于明代的时本系统，但在故事情节上，对时本作了较大的改动。

调腔本《琵琶记》对时本的故事情节的改动，一是增加新的关目，所增加的关目中，有的整出情节都是新编的。如在《思亲》出（汲古阁本《宦邸忧思》）与《剪发》（汲古阁本《祝发买葬》）之间，增加了《起兵》、《闻报》、《三战》等三出戏，演吕布驻军虎牢关，刘备、关羽、张飞起兵，攻打吕布。调腔本增加这一情节，是为了弥补原本的情节安排上的缺陷。原本《宦邸忧思》写蔡伯喈入赘相府、滞留京城，在府中思念留在家中的父母与赵五娘。洛阳与陈留相去不远，却不知道家乡遭遇荒灾，也不知道父母是否还健在。即使自己不能回去，也可遣手下人前往。对于原本中的这些情节安排上的缺陷，前人已经加以指出，如明臧懋循指出：

《琵琶》诸曲颇为合调，而铺叙无当。如《登程》折、《赐宴》折，用末、净、丑诸色，皆涉无谓。陈留、洛阳相距不三舍，而动称“万里关山”；中郎寄书高堂，直为拐儿绐误，何缪戾之甚也。^[4]

又如清李渔也谓：

元曲之最疏者，莫过于《琵琶》，无论大关节目，背谬甚多，如子中状元三载，而家人不知；身赘相府，享尽荣华，不能自遣一仆，而附家书于路人；赵五娘千里寻夫，只身无伴，未审果能全节与否，其谁证之？诸如此类，皆背理妨伦之甚者。^[5]

而调腔本在《思亲》出与《剪发》之间增加了《起兵》、《闻报》、《三战》三出戏，并预先在《思亲》出蔡伯喈所唱的【雁鱼锦】曲中，增加了几句有关吕布把守虎牢关而不能寄书回家的事，如云：“闻知我那里饥与荒，只怕挨不过岁月难存养。如今吕布把守虎牢三关，谩说孩儿回来，就是要寄一封音书，也是不能够了。”由此引出以下三出的情节，这就弥补了原作情节安排上的缺陷。

有的是据明清时期的一些《琵琶记》改本增加的，如在《描容》出，当赵五娘身背公婆画像，准备上路时，特编了一首《琵琶词》：

试将曲调理宫商，弹动琵琶心惨伤。不弹雪月风花事，且把历代源流诉一场。混沌初开盘古事，三才御世号三皇。天生五帝相继续，尧舜心传夏禹王。禹王后代昏君出，乾坤转意属商汤。商汤之后纣为虐，伐罪吊民周武王。周室东迁王迹熄，春秋战国七雄强。七雄吞并为一国，秦室纵横号始皇。西兴汉室刘高祖，光武中兴后献皇。此时有个陈留郡，陈留有个蔡家庄；蔡家有个读书子，才高班马饱文章。父亲名唤蔡崇简，母亲秦氏老萱堂。生下孩儿蔡邕的，新娶妻房赵五娘。夫妻新婚才两月，谁知一旦拆鸳鸯。幸逢朝廷开大比，张公同劝赴科场。苦被堂上亲催遣，不由妻谏两分张。指望锦衣归故里，谁知一去不还乡。自从与夫分别后，陈留三载遇饥荒，公婆受馁谁为主？妻子耽饥实可伤。可怜三日无餐饭，幸遇官司开义仓。家下无人孤又苦，妾身亲自请官粮。行到无人幽僻处，里正抢去甚慌张。奴忆回家无计策，将身赴井泪汪汪。遇得张公来搭救，分粮与我食姑嫜。粮米兑作二亲膳，奴家暗地自挨糠。不想公婆来瞧见，双双气倒在厨房。慌忙救得公苏醒，不想婆婆命已亡。自叹奴家身运蹇，岂知公公又黄粱。连丧双亲手莫措，香云剪下卖街坊。又遇太公施仁义，刻腑铭心怎敢忘。孤坟独造谁为土，指头鲜血染麻裳。孝感天神来助力，搬泥运土事非常。筑成坟墓神吩咐，改换衣装往帝邦。画得公婆仪容像，迢遥岂惮路途长。琵琶拨词亲觅食，敬往京都寻蔡郎。皋鱼杀身以报父，吴起母死不奔丧。宋弘不弃糟糠妇，黄允重婚薄幸郎。此回若得夫相见，未审两下得成双？从头诉尽千般苦，只恐猿闻也断肠。

这首《琵琶词》无论在陆抄本、巾箱本等元本系统的版本中，还是汲古阁本等时本系统的版本中皆无。赵五娘身背琵琶，赴京寻夫，弹唱《琵琶曲》应是《琵琶记》的关键性情节，剧也因此而名，显然，原本无《琵琶词》这是情节安排上的缺陷。而在晚明的一些戏曲选本中，如《词林一枝》、《大明春》、《乐府红珊》、《玉谷新簧》等戏曲选集所收录的《琵琶记》选折中，皆有《琵琶词》，而这些选集中的《琵琶词》，当是根据民间流行的改编本收录的，故不见于明代的一些坊刻本。而调腔本《琵琶记》也正是根据明清时期民间流行的改编本增加的。

二是在原本所描写的情节中，插入了一些新的情节。这些新插入的情节，有的是为了增强舞台效果，如《训女》出（汲古阁本《丞相教女》），原本当牛相回到府中，得知老姥姥与惜春不习女工，到后花园戏耍，便责罚两人，原本只有几句对白，而调腔本《琵琶记》在此处增加了一段爱春与惜春之间的科诨，如将调腔本与汲古阁本中相应的情节比较如下：

续表

调腔本《琵琶记》增加了这一段情节后，与原本相比，显然，大大增强了舞台效果。

有的是为了加强前后情节之间的联系。如原本《南浦嘱别》出在蔡伯喈与赵五娘嘱别之前，让蔡公、蔡婆和张大公直接下场。而调腔本在《大别》出后，先让张大公下场，蔡公、蔡婆仍留在场上，增加了一段科白，如：

蔡崇简：安人进去，待孩儿好起程。

蔡母：你先进去。

蔡崇简：啊，安人，为何眼眼看着孩儿？

蔡母：我看了这一眼，勿知有得看没得看哉！

蔡崇简：唔，进去了！

蔡母：我有几句说话，对孩儿讲，我就进来了。嗳，儿呀，你去到半途路中，只说试官没有功夫，勿考哉，回来了吧。

蔡崇简：唔，什么说话！进去了！

蔡母：我个肉呀！我个肉呀！我个阿邕肉咳！……（下）

蔡崇简：你今日起程，为父有几句言语嘱咐你。你未晚先投宿，鸡鸣早看天，逢桥须下马，过渡莫争先。儿呀，为何堕下泪来？

蔡伯喈：孩儿虑爹妈年老。

蔡崇简：嗄！虑爹妈年老，你母亲却老了，为父的还不老。

蔡邕：孩儿不信。

蔡崇简：嗄！你不信，待为父悬了倚杖，在这厅堂之上，行走几步与你看。（行不几步，作踉跄介）

蔡邕：啊呀，爹爹呀！

蔡崇简：为父说便这等说，你看为父须鬓皓然，你此去有官无官，早寄音信回来，免得爹娘悬望。为父还不老，放心前去。（下）

调腔本在增加了一段科白后，待蔡公、蔡婆下场，便让蔡伯喈和赵五娘留在场上，过渡到《小别》出，即原本《南浦嘱别》出的后半出《嘱别》。(www.daowen.com)

三是调整场次，如将原本的《南浦嘱别》分为《大别》、《小别》两出，《大别》出，演蔡伯喈与父母告别；《小别》出演蔡伯喈与赵五娘夫妻二人分别。在《小别》出开头，赵五娘“送茶上”，并增加了赵五娘与蔡伯喈的一段对白：

赵五娘：解元，琴剑书箱挑在前面，书箱钥匙收好。

蔡邕：卑人晓得。

赵五娘：妻子禀过公婆，还须短送一程。

这样就很自然地过渡到《小别》的情节。

再如原本《杏园春宴》出，演状元及第后，骑马游街，赴琼林宴。调腔本将原本此出分为《点马》、《琼林》两出，《点马》出演河南府首领官检点状元游街骑乘的马匹和琼林宴；《琼林》出演蔡伯喈与及第士子骑马赴琼林宴。

又如原本《义仓赈济》出，演陈留遭遇荒年，官府开粮仓赈济贫民。但仓中粮米皆被里正贪污。赵五娘前来领粮，放粮官命里正赔偿赵五娘。赵五娘领了粮米在回家途中，里正将粮米夺了回去。而调腔本将原本此出分为《赈济》、《抢粮》两出，《赈济》出演放粮官开仓赈济和赵五娘领米；《抢粮》出演里正妻子抢夺赵五娘粮米。

四是对原本的情节加以改写。如原本《文场选士》出中，丑（落得嬉）因侮辱了试官，被试官赶了出去，落第回家。而调腔本对这一情节作了改编，最后骆得喜因巧妙地回答了试官的谜语，也得以高中。调腔本在试官李奎要将骆得喜赶出去时，为两人设计了一段对白：

李奎：啊啾！啊啾！你一肚狗粪，送与我试官大人下酒？黑墨涂脸，赶出去！

骆得喜：哈……！

李奎：你为何发起笑来？

骆得喜：生员三年难过，要来告考。

李奎：我且问你，你几时会笑的？

骆得喜：生员落地会笑的。

李奎：怎么你落地会笑？我试官大人三朝才得会笑。我就把四笑与你猜，猜得着，就中了你。

骆得喜：啊，骆家祖宗，全靠四笑者呢！

李奎：两个农夫在田中笑？

骆得喜：久旱逢甘霖。

李奎：两个行人在途中笑？

骆得喜：他乡遇故知。

李奎：两个新人在房中笑？

骆得喜：洞房花烛夜。

李奎：试官与举子在场中笑？

骆得喜：金榜挂名时。

李奎：好！就中了。

又如原本《拐儿绐误》出中，只有一个拐儿来状元府行骗；调腔本《大拐》出增加了两个骗子，即大拐与马扁三，两人一起来到状元府行骗。原本这出戏的主角是蔡伯喈，全出戏由他主唱。而在调腔本中，大拐与马扁三成为主角，而且全出戏以两人之间的插科打诨为主。

另外，由于调腔本较原本增加了一些情节，因此，也增加了一些人物。如原本中牛小姐的丫环只有惜春一人；调腔本增加了爱春。又如调腔本因增加了《起兵》、《闻报》、《三战》等三出戏，这样，也较原本增加了刘备、关羽、张飞、吕布、探子等人物。